法律分析：公章被偷盖在借条上是否有效应当根据实际而定，如果存在真实的借贷关系，那么是公司是需要履行有关法律义务的，但可以追究偷盖印章人员的法律责任，如果涉及到诈骗行为那么借条是无效的。
法律依据：《中华人民共和国民法典》
第六百六十七条款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。
第六百六十八条款合同应当采用书面形式，但是自然人之间借款另有约定的除外。
借款合同的内容一般包括借款种类、币种、用途、数额、利率、期限和还款方式等条款。
第六百六十九条立借款合同，借款人应当按照贷款人的要求提供与借款有关的业务活动和财务状况的真实情况。