宝马x3十大缺点：发动机噪音太大、熄火隐患、变速箱挂挡异响及漏油、刹车失灵、漏水、固定螺栓有可能松脱、各种异响问题、车辆自燃、发动机启停功能高原地区无法使用、轮毂氧化。
1、发动机噪音太大，点火着车后声音听起来就像柴油机，怠速下还会出现哒哒哒的声音，也有车主反映这款发动机在中期会出现漏油和渗油现象。
2、熄火隐患，由于电动燃油泵的供电线束与燃油输送单元上的压力调节阀存在设计缺陷，宝马X3的发动机存在熄火隐患。宝马官方也曾就此事召回了一批宝马X3。
3、变速箱挂挡异响及漏油，有车主反映，车子在挂前进挡或后退挡时，底盘有砰砰声，经检查发现变速箱漏油，4S店方面最终确定是异响由传动系统和变速箱造成。
4、刹车失灵，有车主反映自己的宝马X3汽车，在成渝高速行驶的时候，刹车失灵，从而引发了交通事故。事后检查发现，是三元催化器堵塞导致的真空泵毁坏引起的刹车失灵。
5、漏水，车主反映，新车开了几个月后，后备箱出现漏水痕迹，更换密封胶条和模块后还是不能解决问题，最后连音响模块也受到漏水问题影响。
6、发动机可变气门正时机构（VANOS）外壳上的固定螺栓设计原因，发动机运转过程中，固定螺栓有可能松脱甚至断裂，存在安全隐患。
7、各种异响问题，转动方向盘转向柱会发出“鹅鹅”的声音；冬季冷车启动发动机哒哒哒声音大；前桥颠簸路面异响；左前车门升窗异响玻璃升到顶时声音特别大等等。
8、车辆自燃，有车主反映，在广园快速行驶的时候，发现车子不对劲，停车熄火检查，发现漏油的情况，大约1分钟之后车前盖开始着火，最后把车子烧的面目全非。
9、发动机启停功能高原地区无法使用，有车主投诉道，车子在重庆可以使用发动机启停功能，但是一到西藏就使用该不了启停功能，宝马官方也承认了这个技术缺陷，但没有得到解决。
10、有车主发现自己的爱车轮毂出现氧化，出现明显锈迹和褪色。