制作水豆腐的步骤如下：
首先，挑选优质大豆。理想的豆子应该是豆脐色浅、含油量低，豆粒大且皮薄，饱满且表面光滑。在适宜的季节和水温下，进行浸泡。春秋季需浸泡12~18小时，夏季6~8小时，冬季则需24小时。以豆与水的重量比1:3为宜，泡好的豆子大约是原料干豆的2.2倍。泡豆时间不宜过长，以防影响出浆率。
接着，使用磨浆机进行粗磨和细磨，至少两次，以提高大豆蛋白的提取效率。老豆腐的制作比例为水与干豆3~4:1，嫩豆腐为6~10:1。第一次加水量占总加水量的30%，第二次加水量30%，第三次40%。确保磨出的豆渣细腻无颗粒。
煮浆时，将磨好的豆浆放入不锈钢煮浆桶，用蒸气加热至60~70℃，并加入适量食用消泡剂。煮沸后保持3~5分钟以消除泡沫。
接下来，豆浆需冷却至35℃以下，此时开始点脂，即添加凝固剂。老豆腐每公斤浆需加30克β－葡萄糖酸内脂，嫩豆腐则需24~30克。将溶解好的内脂慢慢倒入冷却的豆浆中，搅拌均匀。
最后，将点脂后的豆浆倒入模具，放入恒温80~85℃的凝固槽中，保持20分钟，待其自然冷却后，水豆腐就完成了。
一种说法是，水豆腐就是新鲜成型的豆腐，以为其含水众多而称其为水豆腐，又白又嫩。可以用来做菜。另一种说法是，水豆腐是豆浆加石膏煮熟后，还没放进容器压榨成型的豆腐，相对前一种来说，这种豆腐更加的嫩，一般当小吃来吃。（如图所示）水豆腐烘干之后就成了干豆腐，又叫豆腐干或者豆干或者又叫香干。