熊汉鹏教授在科研领域取得了显著成就，近年来主持完成了多项省级重要课题，其中包括：
《双侧分期开胸共切除十四肺段治疗广泛重症支气管扩张》填补国内空白，达到国内先进水平，为两肺广泛病变的外科治疗提供了重要参考，荣获1998年江西省科技进步三等奖。
《双侧肺部同期手术治疗双侧同期气胸》创新性技术减少了患者痛苦，于1999年获得江西省卫生技术创新二等奖。
《长期排菌肺结核外科治疗的临床应用研究》对肺结核防治有积极贡献，于2001年荣获江西省科技进步三等奖。
《难治性大咯血胸外手术的临床应用研究》达到国内领先水平，也于2003年获奖。
熊教授目前正进行的省科委课题包括《肺容积减少术治疗慢阻肺》、《小切口肺叶切除术可行性研究》以及《减少胸外手术出血的研究》。
在学术著作方面，熊汉鹏主编了三部医学专著，总计约300万字，其中《胸心血管外科临床手册》更是填补了江西省空白，荣获2000年华东地区优秀科技图书二等奖。他的其他著作如《结核病学》和《肺外科学》也具有重要影响，部分著作即将出版。
在临床实践中，熊教授已成功实施4000余例胸部手术，创新技术如双侧肺部同期手术和非透视下支气管造影等，为多种高危患者提供了有效的治疗方案，显著延长了患者的生存期。
在学术荣誉上，熊教授在江西省十一届胸心外科年会上当选为副主任委员，这是江西省中医院胸心外科领域的重要突破。他被公认为江西省知名胸外专家，多次荣获省级科技进步奖和特殊荣誉，是南昌大学医学院的硕士研究生导师。