首先~生化危机电影和游戏的剧情是没关系的，电影剧情是保罗·安德森 根据游戏瞎编出来的，连不起来。
游戏剧情：
生化危机1：1998年隶属于S.T.A.R.S的吉尔和克里斯一行人在队长威克斯的带领下奉命调查位于浣熊市郊的阿克雷山区一代发生的一系列生化怪物攻击人类事件。随之小队接连受到生化怪物攻击，吉尔、克里斯、威克斯等幸存者撤到一座洋馆里。经过调查发现，坐落在浣熊市郊的阿克雷山区的这一别墅原来地下埋藏着一个大型生化兵器研究所。属于安布雷拉公司旗下的研究所因为找到不明原因的破坏导致所内的病毒泄露，这正是导致一系列怪物袭击的元凶。随后吉尔等人发现S.T.A.R.S内部出现了叛徒，队长威克斯原来正是安布雷拉安插到警队里，安排S.T.A.R.S进入阿克雷山区与生化怪物遭遇，并收集关于生化兵器战斗后数据的“间谍”！最后威克斯被他放出来的“终极生化兵器”--暴君杀害（假死）最后吉尔与克里斯击倒暴君，逃离了洋馆。
生化危机2: 1998年，洋馆事件过去后，克莱尔来到玩熊市区寻找失踪了的哥哥克里斯，途中遭遇丧失攻击，被同天刚准备到警局报道的新任警员里昂就下。他们发现整座浣熊市已变成人间地狱，到处都充斥着食人的丧失和各种怪物，随后两人分头在浣熊市展开调查。克莱尔继续寻找哥哥的下落，而里昂则负责竟可能的搜救幸存者。途中克莱尔遇到了安布雷拉研究所主要研究院威廉·柏金的女儿雪莉，而里昂则遇到一位身份神秘的华裔女子艾达。得知这一切都与警察局局长和安布雷拉有莫大关系后，克莱尔与里昂进入安布雷拉摧毁病毒与安布雷拉研究所。
生化危机3： 同时在1998年，浣熊市中的吉尔从旅店出来后发现浣熊市已被病毒感染，他逃到警察局里，途中遭遇到了穿着褐色大衣的巨大怪物“追踪者”的袭击。随后遇到安布雷拉派来“营救市民”的UBCS成员卡洛斯一行，他们一同准备坐火车逃离浣熊市，但火车遭到了“追踪者”的袭击，撞向市郊的钟楼，他们有联系直升飞机救援，但又被阴魂不散的“追踪者”用火箭筒炸毁了前来救援的直升飞机。最后他们逃离到了安布雷拉的研究所内，知道了政府得知浣熊市以经全部被病毒感染准备放核弹，对浣熊市进行“清理”。吉尔等人意识到这将会把整个浣熊市从地图上抹去。他们一方面继续联系救援，一方面与“追踪者”在安布雷拉内部周旋，最后利用垃圾处理厂的硫酸机器电磁炮干掉了”追踪者“成功赶在核爆之前撤离了浣熊市。
生化危机4：浣熊市时间六年后西班牙一个偏僻村落，其中有个译为”光明之路“的宗教团体绑架了总统的女儿“阿什莉”。作为美国总统保镖的“里昂”被指派前去调查营救。途中发现被”光明之路“所控制村落和村民身上都发生了变异。但与丧尸不同.....他们有思维，有组织。但这种感觉很快让他联想到浣熊市事件。自那以后安布雷拉就已经迫于政府和民众的压力倒闭了。为避免生化危机的再次上演，里昂决定继续追查，经调查里昂发现山中一座古城堡的堡主利用村民发掘一种名为Las Plagas的寄生体以供给光明之路，”光明之路‘拿他开开发研究，以其来控制村民。起初他们决定绑架阿什莉来获得美国总统的支持，但后来发现在阿什莉体内植入寄生虫，并送回总统身边这样他们就能通过美国，统治整个世界！里昂在逃离出来的研究院“路易斯”的帮助下成功的解救病彻底消灭了阿什莉身上和自己之前被植入的寄生虫，期间还遇到了在浣熊市里的艾达，但他知道艾达其实是“威克斯”的一名间谍。所以最后虽然里昂在艾达的帮助下成功的摧毁了“光明之路'的计划并杀死了教主和城堡主，但寄生虫的样本还是被艾达夺走了，这可能使安布雷拉公司势力再起。
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