民国时期，根据《私立学校规则》，学校实行董事会制，凤麓中学在筹备阶段，马骧因远在西安从事慈善事业，无暇长住学校视事，遂令其三子马可民代校长职，主持校务，对有关毕业证验印、教职工聘任、发布文告、学生的处理、财务的预决算等大事，须亲自定夺，并经常拨冗返里指导学校工作。
民国时期，凤麓中学一直保持校长和代校长职数。
1949年6月学校被丹凤县民主政府接管后，英语教师刘万里被指定为临时负责。1950年3月，商洛分区专员公署命牛星瑞为代校长，牛未到职前，由副校长陈永茂主持学校工作。
1950年9月，省教育厅任命杨慎书为丹凤中学校长，杨慎书是新中国成立后丹凤中学第一任中共党员校长。杨到校后，建立学校中层领导机构。时有党员2人，编在县委中心支部，1955年党员增至3名，始设党支部，巩作发兼任支部书记，至此，学校党政领导班子方才健全。1958年3月，专职党支部书记张仲篪到职。
关于领导的配备，丹凤中学曾于1958年向省教育厅打报告，要求增加一名副校长,未果,建国后至1966年，丹凤中学校长(主持工作的副校长)一直保持一个职数。
“文化大革命”十年，丹凤中学领导变动较频。1966年8月，党支部书记张仲篪，副校长王家齐被夺权后，县委文革领导小组任命周树林为代党支部书记，李应儒为代校长。1968年9月，学校革委会成立，主任从结合的原党支部书记张仲篪开始，6人相继任主任或副主任，其中张新铭、任鸿儒为省下派干部，其他4位副主任为学校原领导干部或从本县外单位调入。
1980年3月开始，地委、行署先后决定王维纲、张清贤、周宇、李访山、周春荣相继任校长或党总支书记。书记、校长均为副县级行政级别。同时，县委、县人民政府先后给该校配备十名具有副科级行政级别的干部任专职党总支副书记或副校长。现任校长姚虎山，总支书记刘继华，副校长刘成民、王晓娟、刘涛。 校 长 马 骧 男 陕西商县龙驹寨 专科 1942.9 1949.5
代 校 长 马可民 男 陕西商县龙驹寨 本科 1942.9 主持工作
代 校 长 牛星瑞 男 丹凤西河 中师 1949.3 1950.8
校 长 杨慎书 男 陕西武功 专科 1950.9 1960.8
校 长 卢永昌 男 陕西洛南 大学肄业 1960.9 1963.8
主 任 张仲篪 男 陕西长安 高中 1968.3 1970.3
主 任 张新铭 男 河南巩县 本科 1971.10 1973.8
主 任 任鸿儒 男 陕西华阴 本科 1972.10 1975.8
校 长 王维纲 男 丹凤大峪 中师 1980.10 1982.3
校 长 张清贤 男 陕西洛南 本科 1982.12 1984.3
校 长 周 宇 男 丹凤龙驹 本科 1984.4 1995.8
校 长 周春荣 男 丹凤商镇 本科 1995.8 2001.9
校 长 李东亮 男 丹凤茶房 本科 2001.11 2015.6
陕西省丹凤中学历任副校长
副主任 贺进奎 男 丹凤西河 本科 1971.12 1977.8 主持工作
副主任 李忠勋 男 丹凤茶房 中师 1976.9 1979.8 主持工作
副校长 张志丰 男 河南偃师 高中 1979.8 1980.10 主持工作
副校长 王兴让 男 商县腰市 中师 1977.9 1982.11 主持工作
副校长 安振仓 男 陕西渭南 专科 1980.1 1983.1
副校长 彭 飞 男 丹凤商镇 本科 1978.1 1981.8
副校长 张福久 男 丹凤龙驹 本科 1985.2 1993.5
副校长 石致义 男 丹凤茶房 本科 1985.2 1992.5
副校长 许水兆 男 丹凤棣花 本科 1993.5 1995.10
副校长 李东亮 男 丹凤茶房 本科 1996.1 2001.11
副校长 刘成民 男 丹凤茶房 本科 1999.9
工会主席 王喜良 男 丹凤商镇 本科
副校长 李书君 男 丹凤商镇 本科 2002.8
副校长 王晓娟 女 丹凤茶房 本科 2004.8
