光学显微镜和电子显微镜最大的区别莫过于放大倍数，光学显微镜看到的以微米来表述，主要是细胞的形态结构，当然低倍镜高倍镜油镜看到的不能统一而论，而电子显微镜看到的以纳米表述，观察到的是细胞的超微结构，当然电子显微镜也有很多类型，这里就不再赘述了。
光学显微镜能观察到细胞核，可以明确核膜就包裹着细胞核，但核膜具体啥样，光学显微镜就无能为力了，只能看到点核膜的线索。观察细胞核最好进行染色，最简单的就是碘液染色了，中学实验常用，像血液学有瑞氏染色，病理学有巴氏染色等等。
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