从化学角度讲，朱砂学名硫化汞，属于共价化合物，溶解度低，很难被人体吸收，而真正有毒的是游离汞。
中药使用朱砂，采用水飞法炮制，就是球磨机磨碎朱砂过程中加水，避免温度过高分解产生游离汞。而且中药制药过程采用的是GMP标准，每一步都有严格控制，不会产生游离汞。
朱砂作为常用传统中药材，始载于中国第一部药物学专著《神农本草经》。在现行的2010年版《中国药典》中，朱砂具有清心镇惊、安神、明目、解毒的功效。
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朱砂有慢性毒性反应也不是新话题。中医对此有明确认识和记载。古籍中多记载了朱砂独用、多用可致痴呆或发疽毒，但中医用药讲究配伍，与西药的唯成分论不能放在一个维度上评价。
朱砂等含汞中药引发毒性反应的主要原因，是错误地将含汞药物作为保健药物，超量、超时使用。中医服药讲究‘中病即止’，只要在医生指导下，按照安全剂量、用药时间服用，就不会引发毒性反应。
参考资料来源：人民网—中医药专家称朱砂入药无毒“汞超标”有疑义
首先我们我们今天谈及的朱砂是否有毒等话题，所谈及的是天然的朱砂。并非压制的朱砂，人工还原砂等。这点提前说明很重要。下面晶石上的舞者科普开始：
那么朱砂入药真的安全吗？朱砂的主要化学成分是硫化汞，有人认为因为含有汞就是有毒的，其实就目前我们的只是来看硫化汞对人体基本是没有毒害作用的。所以可以说是没有毒性的。
谈到毒副作用，首先我们要说明一个问题。那就是一个化合物的毒性和它所含有的元素的单质毒性是不能完全联系在一起的，具体说一下，我们知道金属钠它的毒性和氯气它的毒性都是对人体伤害能力很强的，可是他们组成的化合物氯化钠，也就是我们日常所食用的食盐，是我们每天都在吃的，应该是没有毒性的。所以一个化合物的毒性跟他含有哪种元素是没有本质的必然联系。那么同样对于汞的化合物也是一样，硫化汞它含有汞，它不等于有汞单质的性质。
硫化汞的溶解度非常低，基本上可以认为是绝对不溶于水的。所以朱砂这种以硫化汞为主的物质，就几乎没有任何危害。如果用朱砂入药是可以利用它的一些功能去发挥它的治疗效果。
科学来看呢，是没有毒的。但是如果用做药物肯定计量也不会多的。还有如果作为首饰佩戴就更加安全没有问题了！
临床毒副作用
动物实验表明，口服朱砂的吸收半衰期为0.2h，血液中汞含量达峰值时间为11h，而汞有人体内的半衰期为65——70d，证明朱砂的吸收并不缓慢，但排除缓慢，体内滞留时间长，容易形成蓄积性中毒。据宋氏研究结果显示，朱砂内服过量有毒是肯定的，无机汞人体吸收率为5%，甲基汞的吸收率可达100%，朱砂（HgS）在厌氧有硫的条件下，温度在37℃的环境中与带甲基的物质相遇均能产生甲基汞，而人体的肠道正具备这一条件，故内服朱砂制剂更增加了中毒机会。实验研究证明，当人体内汞蓄积量达到100mg时即有感觉障碍，重者表现神经毒害，循环衰竭而死亡。汞吸入血后通过生物膜进入红细胞与血红蛋白的硫基结合，可侵害脑细胞、胎儿、精子、卵子、心、肝、肾等，还影响部分酶的功能。动物实验表明，孕兔内服朱砂后，胎盘中含汞量比肝、肾、心脏都高，说明朱砂中汞极易通过胎盘危害胎儿，而婴幼对汞等有害重金属的生理性屏障作用及肾脏排泄功能尚不完善，较成人更易形成积蓄性中毒。汞还是目前唯一被证实可引起人类胎儿畸形的重金属。动物实验证明，雌鼠口服朱砂后，不仅可使自身受到损害，而且受孕率降低，生育能力下降。
研究资料证明，当人体中汞蓄积量达100mg时，即可产生中毒反应，若以100mg作为朱砂蓄积中毒指标，按汞代谢的半衰期65——70d推算，每天吸收10mg汞，则10.5d即可达到100mg的蓄积量。又据无机汞的吸收率5%推算，人体每天服用233mg朱砂，即可吸收汞10mg，根据《中国药典》（2000年版）朱砂的用量100mg——500mg/d推知，连续服用7d左右即可在体内达到100mg的蓄积中毒量，因此连续服用朱砂及其制剂不宜超过7d，因特殊情况需长期服用朱砂及其制剂，必须密切关注不良反应的发生，及时应用解毒剂二硫基丙磺酸钠等药物治疗。本回答被网友采纳
朱砂有毒。
朱砂又名丹妙、辰砂、赤丹、汞砂，为天然的辰砂矿石，汞含量高，“有安神镇惊、清心解毒之功效，是历代中医治疗心悸心慌、失眠颠狂的要药之一。然而，“是药总有三分毒”，朱砂也不例外，近年来，过服久服朱砂引起毒副反应甚至中毒致死的病例亦有发生，应当引起医生和患者的高度重视。一般来说，朱砂中毒可有下列临床表现：
1、消化系统：
汞对胃肠黏膜有强烈的刺激性，急性朱砂中毒可引起急性腐蚀性胃炎，一般在服药后不久即觉心窝部烧灼样疼痛或绞痛、口渴、呕吐带有黏膜碎片的糊样物等；慢性中毒的临床表现有食欲不振、恶心呕吐；腹痛、腹泻，并可引起上消化道出血（呕吐物为黑色水样物、大便呈咖啡色）；口腔病变表现为口中有金属味、流涎、牙龈充血、肿胀、溃烂、出血、牙齿松动脱落、牙根部牙龈上有黑色汞线；对肝脏的损害可引起肝肿大、肝功能异常。
2、神经系统：
早期表现为头皮麻木、视物模糊、睡眠不安、躁动多言、言语不清、易怒、胆小、幻觉、行动怪僻；后期可出现意识淡漠、朦胧以至意识丧失、肌肉震颤等症。
3、心血管系统：
可引起中毒性心肌炎，心律紊乱，血压下降。心电图出现ST段下降、T波高尖等；中毒严重时可导致心力衰竭。
4、泌尿系统：
汞主要经过肾脏排泄，因此可以引起肾小管上皮肿大、坏死，出现尿少、浮肿、尿蛋白、红细胞及管型，甚至少尿或无尿，最终导致肾功能衰竭、尿毒症而死亡。
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对于单味朱砂或含有朱砂成分的中成药，不宜超量或持久服用，尤其肝、肾功能不正常者，更不宜服用朱砂，以免造成汞中毒而加重病情，出现中毒症状者应及时送医院救治，以免发生意外。
中国是世界上出产辰砂最多的国家之一。主要产地是贵州东部和湖南西部，以质好量大而出名。产出的矿砂多数运到湖南西部的辰溪，再转销全国各地，辰溪成为当时辰砂主要的集散地，“辰砂”一名也由此而来。世界上最大的辰砂晶体是“辰砂王”，1980年在贵州东部万山汞矿区发现。长10.8厘米，宽4.4厘米，高4.2厘米，净重237克。现收藏于中国北京地质博物馆。
参考资料：/www.china.com.cn/health/txt/3905-09/30/content_6239419.htm"target="_blank"title="中国网-朱砂有毒别多服">中国网-朱砂有毒别多服
参考资料：/baike.baidu.com/item/%E8%BE%B0%E7%A0%82/2298305?fromtitle=%E6%9C%B1%E7%A0%82&fromid=905091"target="_blank"title="百度百科-朱砂">百度百科-朱砂