法律分析：1、未来使用费用不同：商住两用房一般水、电、暖等使用费用都将采取商用价格。而普通住宅一般是按照民用水电费标准收费的，价格比较低。
2、相关税费的差异：普通住宅项目初次购买和未来转让时契税为1.5%，而商住两用房50年产权的住宅，其契税按3%缴纳。
3、贷款条件的限制：购买此类房屋大多不能申请公积金贷款，但是也有少数项目在开发商的努力下能够办到。另50年产权或者40年产权的住宅，如采用银行贷款的方式，只能得到五成或六成按揭。
4、建设标准不同：如果按照公建相关要求，前者的人防和消防等建设标准较高，对开发商而言，成本将提高。
5、土地性质不同：商住房是商业用地或综合用地，住宅则是住宅用地，商业用地一般用于规划商业、娱乐、经营性建筑，综合用地一般用于规划商业和住宅，住宅用地规划住宅。
6、使用年限不同：商住房的使用年限为40或50年，住宅则为70年。
7、产权到期规定不同：住宅的使用权到期后一般会自动延续，非住宅则要根据相关法律规定，做出有偿补偿。
法律依据：《中华人民共和国民法典》 第三百五十九条 住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期。续期费用的缴纳或者减免，依照法律、行政法规的规定办理。
非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋以及其他不动产的归属，有约定的，按照约定；没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。