企业整体转让土地及附上的自建厂房,需要交纳
营业税：房地评估值或成交值*5%
土地增值税：土地评估值*3%(可以一次性核定征收,可以不用土地增值税的五档税率)
印花税：合同金额万分之五
城建税：为营业税的7%，5%或1%
教育费附加：为营业税的3%
堤围费是地方性附加费，建议查一下当地财政部门的相关规定
不交契税，契税是由买受人交纳的，跟贵公司无关
企业所得税按应税所得的25%计征，是根据企业所有所得来计算的，并不是单独计算的
但是也听说企业所得税按3%征收,而且是在办理房屋转让时征收,如果是这样，所得税的3%（收入为基础）有可能是代征的税率，在年末还需按25%（应税所得为基础）进行汇算清缴
转入清理（假设你没有折旧过）
借：固定资产清理
贷：固定资产
收取房款
借：银行存款
贷：固定资产清理
缴纳税费
借：固定资产清理
贷：应缴税费--各税费
转让的手续费等一切清理费用
借：固定资产清理
贷：银行存款或现金
结转销售厂房取得的净收益
借：固定资产清理
贷：营业外收入
具体的税费咨询当地税局
参考资料：互联网