1、概念不同
国有企业，是指国务院和地方人民政府分别代表国家履行出资人职责的国有独资企业、国有独资公司以及国有资本控股公司，包括中央和地方国有资产监督管理机构和其他部门所监管的企业本级及其逐级投资形成的企业。
三资企业即在中国境内设立的中外合资经营企业、中外合作经营企业、外商独资经营企业三类外商投资企业。三资企业是经中国有关部门批准，遵守中国有关法规规定，从事某种经营活动，由一个或一个以上的国外投资方与中国投资方共同经营或独立经营，实行独立核算、自负盈亏的经济实体。
2、组织形式和法律地位区别
中外合资企业是公司形式的企业单位，属于有限公司，是中国法人，具有独立的财产权。
中外合营企业是一个合伙企业，组织形式不明确。它可以是具有中国法人资格的企业，具有独立的财产权；也可以是一个松散的经济联合体，不取得中国法人资格，没有独立的财产权。
外资企业大都也是有限责任公司，企业的全部注册资本为外国投资者投入，是具有中国法人资格的企业。
国有企业分为中央企业（由中央政府监督管理的国有企业）和地方企业（由地方政府监督管理的国有企业）。 对于个别中央企业在国家社会经济发展过程中所承担的责任较为特殊，归属于国务院直属管理，这些中央企业属于正部级。
3、投资方式区别
中外合资企业，合营各方必须都投资，投资内容包括：现金、工业产权、实物和场地使用权。这些投资一律折算为注册的币值，从而确定各自的股份。其注册资本是合营各方认缴资本的总和。
中外合营企业投资，可以采用合资经营的出资方式，也可以采用合营各方提供的合作条件(包括现金、工业产权、实物和场地使用权)。但合营各方提供的合作条件必须折算为注册的币值，因而没有可比的数量概念，也就没有股份的比例。外资企业的出资方式是外商独自提供，其注册资本均由外国投资者投入。
国有企业一直是政府支持和扶植的对象，国有企业的建立，其中政府税收的很大部分都投入到国有企业中，大量的国有企业因此建立和出现，有的国有企业还是由原来的政府部门转变而来的。中国的国有企业按《中华人民共和国企业法人登记管理条例》登记注册，资产的投入主体是国有资产管理部门的，就是国有企业。
在中国境内设立的中外合资经营企业、中外合作经营企业、外商独资经营企业三类外商投资企业，称为三资企业。
国有企业，在国际惯例中仅指一个国家的中央政府或
联邦政府投资或参与控制的企业。在中国，国有企业还包括由地方政府投资参与控制的企业。政府的意志和利益决定了国有企业的行为。国有企业作为一种生产经营
组织形式同时具有营利法人和公益法人的特点。其营利性体现为追求国有资产的保值和增值。其公益性体现为国有企业的设立通常是为了实现国家调节经济的目标，
起着调和国民经济各个方面发展的作用。