第一，预算和标底均属资金概算，二者重合度将进一步提高。所谓预算，这里是指项目支出预算，是在采购项目立项时对项目所需采购资金的大体概算；所谓标底，通俗地说，就是项目造价，更多是指工程项目造价，是基建工程的预期价格。由此可见，预算和标底，都是采购项目资金的大体概算或预期价格，是采购人可用资金额度及在财务上应承担的义务。
第二，预算和标底适用范围不同，规定和要求各有侧重。我国《政府采购法》和《招标投标法》对预算和标底的规定，各不相同，各有侧重:《政府采购法》对预算提出了明确要求，《招标投标法》对标底进行了原则规定。
第三，标底是评标的参考，预算与评标无关。标底是评标的重要参考，《招标投标法》第40条规定“对招标文件进行评审和比较，设有标底的，应当参考标底”。但如何参考标底，法律没有明确规定。在具体操作实践中，一般是将标底作为评标基准价，标底是评标、定标的重要依据，作为价格得分的尺度和准绳，离标底越近，价格得分越高；无论价格高低，只要偏离标底，均将减分，偏离越远，价格得分就越低。对于高于标底的报价，予以减分，倒可以理解；但对于投标报价低于标底的，也作减分处理，这与政府采购“价格得分采用低价优先法计算”的规则相违背，也不符合政府采购提高采购资金使用效益的价值目标。
第四，标底强调必须保密，预算没有明确要求保密。标底决定价格得分高低，甚至决定是否中标或废标，因此标底属于保密内容，在开标前不得向任何人泄露。《招标投标法》第22条明确规定“招标人设有标底的，标底必须保密”。
第五，必须编制预算，不宜设定标底。预算是项目采购的前提，是签订合同的依据，是项目付款的保障，《政府采购法》第6条规定“政府采购应当严格按照批准的预算执行”。因此，作为财政或财务管理部门，必须科学编制采购预算，细化项目预算；作为采购机构，必须严格按预算采购，没有预算不得采购；作为采购人，必须按采购预算签订合同，并严格按照合同办理付款。