正本就一个，现收藏于北京故宫博物院。张择端所绘，一千多年来，《清明上河图》声名显赫，广受青睐，仿摹者众多。现在，国内外各地公私藏家手中还有许多摹本和伪造本，据统计，目前国内外公私所藏的《清明上河图》有30多卷。中国内地藏有10余幅，中国台湾省藏有9幅，美国藏有5幅，法国藏有4幅，英国和日本各藏有1幅。
各个版本反映了不同时代的风俗，这也就更增添了《清明上河图》作为风俗画的价值。
下面着重介绍三个版本:
第一个版本是宝笈三编本。
《石渠宝笈》是清朝乾隆、嘉庆两代皇帝组织全国学者、画家、鉴赏家对于清朝皇宫、御苑、行宫等陈设、储存的书画文物进行大普查后，分别进行鉴定登记、造册。《石渠宝笈》是中国书画著录书，共有三编，初编成书于乾隆十年（1745年），共四十四卷；二编成书于乾隆五十八年（1793年），共四十册；三编成书于嘉庆二十一年（1816年），共二十八函。书中收录的均为清朝宫廷所藏之书画作品，是我国书画著录史上集大成者的巨著，汇集了清皇室收藏最鼎盛时期所有作品。全书修编定稿后，即指定专人以精整的小楷缮写成朱丝栏抄本两套，分函加以保存。《清明上河图》现藏于北京故宫博物院。从宋到今，流传有序，题跋、印鉴历历可数，并著录在《石渠宝芨三编》里，较多的人认为宝笈三编本为张氏真迹。现藏于故宫博物院，所以被称为《清明上河图》故宫藏本。
第二个版本是“吴门四家”之一，明代著名画家仇英，根据“清明上河”这一题材，参照“宋本”的构图结构，以明代苏州城为背景，采用青绿重设色方式，重新创作了一幅全新画卷，风格与宋本迥异。“仇本”也是后世众人仿作的鼻祖，明人笔记载，当时各种以此为蓝本的仿作层出不穷，一时间成为达官豪门相互馈赠的高档礼物。被称为仇英仿本或仇本。现为辽宁省博物馆藏。
仇英的《清明上河图》参照了张择端真迹的构图形式，采用青绿重设色方式，描绘明代苏州城的社会生活情景，画中人物超过2000，神态各异，栩栩如生，画作长9.87米，比宋本长近一倍，高0.3米，风格与宋本迥异，是历代仿本中最好、价值最高的一件，代表了后世《清明上河图》题材创作的典型风格和最高水平。
仇英，字实父，一作实甫，号十洲，是明代代表性画家之一，与沈周、文征明和唐寅并称为“明四家”，其画作传世极少，太仓人(今江苏太仓)，居苏州，约生于明弘治十一年(一四九八年)，卒于嘉靖三十一年(一五五二年)，彩绘漆工出身，后来师从苏州画家周臣学画，打下了扎实的绘画功底，年轻时以善画结识了许多当代名家，得到苏州画坛前辈大师沈周、文征明的点拨，为文征明、唐寅所器重，并曾在著名鉴藏家项元汴、周六观家中见识了大量古代名作，临摹创作了大量精品，逐渐跻身名家行列。其绘画技艺全面精湛，风格多样，工山水、人物、花鸟，尤善摹古。
仇英版的《清明上河图》，沿运河从苏州城郊的风景入画，过虹桥，至城门入市区，直至西部城郊，以田园牧歌景象开篇，以一段水上仙台收束。将四百多年前的明代苏州城和江南的风物人情尽呈读者面前。这里有山川、城郭、街巷、桥梁、河道、码头、民居、店面，有舟楫、戏台、校场，还有婚娶、宴饮、雅集、演艺、田作、赶集、买卖、渔罟、测字等场面，是苏州作为江南地区经济文化中心的真实再现。在构图上，既忠实于苏州城山川风物的自然地理环境，又融入作者的创作构思。作者在场景设计和细节处理上匠心独运，全图所描绘的二千二百余人中，男女老幼、士农工商，可谓形形色色，每个人物都能通过动作、神态、服饰、道具等体现出其身份，毫无雷同。人物的衣纹线条挺劲简练，以其聚散转折来突出人物的动态，并根据人物的身份、年龄、性别，施以不同的颜色。以平涂法设色，色彩沉重实厚。
如此宏大的场面绘制，将众多的人物、场景组成生动和谐的画面，不仅需要作者对苏州的山川风物了如指掌，更需要能统揽全局、举重若轻的驾驭能力。作者充分利用了中国画的特点，将重点景物有机地结合在一起，演绎出一部有影无声的活剧。画卷表现的中心是苏州繁华的街市，却从郊外幽静的村庄起笔，与张择端《清明上河图》在构图上有异曲同工之妙。
第三个版本是在乾隆元年（1736年）由清宫画院五位画家陈枚、孙祜、金昆、戴洪、程志道合作画成，可以说是按照各朝的仿本，集各家所长之作品，再加上明清时代特殊风俗，如踏青、表演等娱乐活动，因此增加了许多丰富的情节，如戏剧、猴戏、特技、擂台等等，画的事物繁多，虽然失去了宋代古制，却是研究明清之际社会风俗不可缺的材料。同时，由于西洋画风的影响，街道房舍，均以透视原理作画，并有西式建筑列置其中。此卷用色鲜丽明亮，用笔圆熟细致，界画桥梁、屋宇、人物皆细腻严谨，是院画中极精之作。这个版本现藏于台湾台北故宫博物馆。被称为乾隆年间仿本或清院本。
《清明上河图》的伪本、仿本、摹本、临本很多，但真本毕竟只有一幅。经过众多学者、专家对这一专题的研究，大家意见基本一致，都认为现藏北京故宫博物院的这幅是北宋张择端的原作。其它的同名画作，均为后来的摹本或伪托张择端的臆造本。
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