一级保护动物：
1. 哺乳纲灵长目：蜂猴、倭蜂猴、台湾猴、北豚尾猴、喜山长尾叶猴、印支灰叶猴、黑叶猴、菲氏叶猴、戴帽叶猴、白头叶猴、肖氏乌叶猴、滇金丝猴、黔金丝猴、川金丝猴、怒江金丝猴、西白眉长臂猿、东白眉长臂猿、高黎贡白眉长臂猿、白掌长臂猿、西黑冠长臂猿、东黑冠长臂猿、海南长臂猿、北白颊长臂猿。
2. 鸟纲鸡形目：四川山鹧鸪、海南山鹧鸪、斑尾榛鸡、黑嘴松鸡、黑琴鸡、红喉雉鹑、黄喉雉鹑、黑头角雉、红胸角雉、灰腹角雉、黄腹角雉、棕尾虹雉、白尾梢虹雉、绿尾虹雉、蓝腹鹇（蓝鹇）、褐马鸡、白颈长尾雉、黑颈长尾雉、黑长尾雉、白冠长尾雉、灰孔雀雉、海南孔雀雉、绿孔雀。
3. 爬行纲龟鳖目：缅甸陆龟、凹甲陆龟、四爪陆龟、红海龟、绿海龟、玳瑁、太平洋丽龟、棱皮龟、鼋、斑鳖。
4. 两栖纲有尾目：安吉小鲵、中国小鲵、挂榜山小鲵、猫儿山小鲵、普雄原鲵、辽宁爪鲵、镇海棘螈。
5. 硬骨鱼纲鲟形目：中华鲟、长江鲟、鳇、白鲟。
6. 肠鳃纲柱头虫目：多鳃孔舌形虫、黄岛长吻虫。
7. 昆虫纲蛩蠊目：中华蛩蠊、陈氏西蛩蠊。
8. 鳞翅目：金斑喙凤蝶。
9. 双壳纲帘蛤目：大砗磲。
10. 头足纲鹦鹉螺目：鹦鹉螺。
11. 珊瑚纲软珊瑚目：红珊瑚科所有种。
二级保护动物：
1. 哺乳纲灵长目：短尾猴、熊猴、白颊猕猴、猕猴、藏南猕猴、藏酋猴。
2. 食肉目：狼、亚洲胡狼、貉、沙狐、藏狐、赤狐、懒熊、棕熊、黑熊、小熊猫、黄喉貂、石貂、小爪水獭、水獭、江獭、椰子猫、斑林狸、草原斑猫、渔猫、兔狲、猞猁、云猫、豹猫、北海狗、北海狮、髯海豹、环海豹。
3. 偶蹄目：獐、贡山麂、海南麂、水鹿、马鹿、毛冠鹿、藏原羚、鹅喉羚、长尾斑羚、缅甸斑羚、中华斑羚、北山羊、岩羊、阿尔泰盘羊、哈萨克盘羊、戈壁盘羊、天山盘羊、帕米尔盘羊、中华鬣羚、红鬣羚。
4. 鸟纲鸡形目：环颈山鹧鸪、红喉山鹧鸪、白眉山鹧鸪、白颊山鹧鸪、褐胸山鹧鸪、红胸山鹧鸪、台湾山鹧鸪、绿脚树鹧鸪、花尾榛鸡、镰翅鸡、松鸡、岩雷鸟、柳雷鸟、暗腹雪鸡、藏雪鸡、阿尔泰雪鸡、大石鸡、血雉、红腹角雉、勺鸡、红原鸡、黑鹇、白鹇、白马鸡、藏马鸡、蓝马鸡、红腹锦鸡、白腹锦鸡。
5. 爬行纲龟鳖目：平胸龟、欧氏摄龟、黑颈乌龟、乌龟、花龟、黄喉拟水龟、闭壳龟属所有种、地龟、眼斑水龟、四眼斑水龟、山瑞鳖。
6. 有鳞目：大壁虎、黑疣大壁虎、伊犁沙虎、吐鲁番沙虎、英德睑虎、越南睑虎、霸王岭睑虎、海南睑虎、嘉道理睑虎、广西睑虎、荔波睑虎、凭祥睑虎、蒲氏睑虎、周氏睑虎、巴塘龙蜥、短尾龙蜥、侏龙蜥、滑腹龙蜥、宜兰龙蜥、溪头龙蜥、帆背龙蜥、蜡皮蜥、贵南沙蜥、长鬣蜥、细脆蛇蜥。
7. 两栖纲蚓螈目：版纳鱼螈。
8. 水螅纲花裸螅目：分叉多孔螅、节块多孔螅、窝形多孔螅、错综多孔螅、阔叶多孔螅、扁叶多孔螅、娇嫩多孔螅、无序双孔螅、紫色双孔螅、佳丽刺柱螅、扇形柱星螅、细巧柱星螅、佳丽柱星螅、艳红柱星螅、粗糙柱星螅。
三级保护动物：
1. 哺乳纲：刺猬、达乌尔猬、大耳猬、侯氏猬、树鼩、貉、鼬、白鼬、伶鼬、黄腹鼬、小艾鼬、黄鼬、纹鼬、艾鼬、虎鼬、鼬獾、缅甸鼬獾、狗獾、猪獾、果子狸、小齿椰子猫、缟灵猫、红颊獴、食蟹獴、野猪、赤麂、小麂、菲氏麂、狍、驯鹿、草兔、灰尾兔、华南兔、东北兔、云南兔、东北黑兔。
2. 鸟纲：红喉潜鸟、黑喉潜鸟、小鸊鷉、凤头鸊鷉、白额鹱、灰鹱、短尾鹱、纯褐鹱、白腰叉尾海燕、黑叉尾海燕、白尾鹲、普通鸬鹚、暗绿背鸬鹚、红脸鸬鹚、小军舰鸟、苍鹭、草鹭、绿鹭、池鹭、牛背鹭、大白鹭、白鹭、中白鹭、夜鹭、栗鳽、黄苇鳽、紫背苇鳽、栗苇鳽、黑鳽、大麻鳽。
3. 两栖纲：呈贡蝾螈、蓝尾蝾螈、东方蝾螈、滇池蝾螈、黑斑肥螈、无斑肥螈、强婚刺铃蟾、大蹼铃蟾、微蹼铃蟾、东方铃蟾、沙坪无耳蟾、宽头短腿蟾、缅北短腿蟾、平顶短腿蟾、沙巴拟髭蟾、东南亚拟髭蟾、高山掌突蟾、峨山掌突蟾、掌突蟾、腹斑掌突蟾、淡肩角蟾、短肢角蟾、尾突角蟾。
4. 爬行纲：大头乌龟、黄缘盒龟、黄额盒龟、黄金龟、齿缘龟、艾氏拟水龟、腊戍拟水龟、缺颌花龟、菲氏花龟、锯缘摄龟、拟眼斑龟、砂鳖、东北鳖、小鳖、鳖、隐耳漠虎、新疆漠虎、蝎虎、长裸趾虎、卡西裸趾虎、墨脱裸趾虎、灰裸趾虎、西藏裸趾虎、莎车裸趾虎、截趾虎、耳疣壁虎、中国壁虎。
5. 昆虫纲：江西叉突襀、海南华钮襀、吉氏小扁襀、史氏长卷襀、怪螳属（所有种）、魏氏巨蝓、四川无肛蝓、尖峰岭彪蝓、污色无翅刺蝓、叶蝓属（所有种）、广西瘤蝓、褐脊瘤胸蝓、中华仿圆筒蝓、食蚧双突围啮、线斑触啮、黄脊扁角纹蓟马、墨脱埃蛾蜡蝉、红翅梵蜡蝉、漆点旌翅颜蜡蝉。
以上名录是根据《中华人民共和国野生动物保护法》所规定的一级、二级和三级保护动物，具体条目已按照法律要求进行分类和列举。
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