黑水鸡指名亚种在繁殖期，通常在4月至7月之间进行繁殖活动。它们采取一对一对的繁殖方式，有时也会组成小型的、松散的群体，在苇塘中集中进行繁殖。这些繁殖巢区之间的距离大约为1到3米，以确保足够的隐私和空间。
黑水鸡的巢穴主要建在水边的浅水区域，芦苇丛或者水草丛中，有时也会选择在岸边草丛、水中小柳树上，周围都有芦苇或高草作为天然的掩护，巢穴设计巧妙，呈现出碗状，主要由枯芦苇和草构建而成。巢穴的直径约为20到27厘米，内径10到15厘米，深度3到5厘米，高度15到20厘米。值得注意的是，巢穴并非漂浮在水面，而是紧贴水面，利用弯曲的芦苇作为巢基，再用枯草堆叠而成，非常隐蔽。
每次的产卵数量通常在6到10枚，但也有可能少至4枚或多达12枚。卵形多样，可能为卵圆形或长卵圆形，卵色可为灰白、乳白或赭褐色，表面点缀着红褐色斑点。卵的平均大小为29.8毫米×41.2毫米，重量在16到19克之间，平均重量为17.4克。繁殖过程中的孵卵任务由雌雄亲鸟轮流承担，孵化期大约为19到22天。
新生的雏鸟具有早成性，刚破壳而出时全身覆盖黑色绒羽，嘴尖白色，额甲区域呈现红色。令人惊奇的是，它们在孵化当天就能下水游泳，显示出极高的生存适应能力。这样的繁殖习性和巢穴特征，都展现了黑水鸡指名亚种独特的生态特性。
黑水鸡指名亚种（学名：Gallinula chloropus chloropus）是鹤形目秧鸡科的鸟类，全长约33cm，中型涉禽，嘴长度适中，鼻孔狭长；头具额甲，后缘圆钝；嘴和额甲色彩鲜艳。翅圆形，第2枚初级飞羽最长，或第2枚和第3枚初级飞羽等长，第1枚约与第5枚或第6枚等长。尾下覆羽白色。趾很长，中趾不连爪约与跗蹠等长。趾具狭窄的直缘膜或蹼。通体黑褐色，嘴黄色，嘴基与额甲红色，脚黄绿色，脚上部有一鲜红色环带。游泳时身体露出水面较高，尾向上翘。栖息于水域周围的灌木丛，蒲草，苇丛，善潜水，多成对活动，以水草，小鱼虾，水生昆虫等为食。