混合氨基酸在中性溶液中的主要形式是荷单价负电荷
氨基酸带负电，存在于溶液中 等电点：如果调节溶液的PH值使得其中的氨基酸呈电中性，我们把这个PH值称为氨基酸的等电点：PI。PI是氨基酸的重要常数之一，它的意义在于，物质在PI处的溶解度最小，是分离纯化物质的重要手段。
等电点的计算：1. 由PK’值判断解离顺序，总是PK1’< PK2’< PK3’< …，即谁的PK’值小，谁就先解离。2.按照解离顺序正确写出解离方程式：简式，注意解离基团的正确写法。3.找出呈电中性的物质，其左右PK’值的平均值就是氨基酸的等电点
4. 等电点的测定：等电聚焦法：这是一种特殊的电泳，其载体上铺有连续的PH梯度的缓冲液，然后将氨基酸点样，只要该处的PH与氨基酸的PI不同，则氨基酸就会带电，PH值>PI时，aa带-电；PH值<PI时，aa带+电。
通电后，氨基酸就会移动，直到某处的PH＝PI，氨基酸才呈电中性，不再移动，因此，可以测出PI。 等电点沉淀 所有的氨基酸均为两性物质，亦即它们至少含有一个酸性基（carboxyl）及一个碱性基（α-amino）。
这些可游离的团基在pH变化时，因释出或接受质子而可充当弱酸或弱碱，其离子化特性与其它物质一样遵守Henderson-Hasselbalch方程式： pH = pKa + log10 [未质子化的形式（碱）] / [已质子化的形式（酸）] 即 pH = pKa + log [A-] / [HA] 氨基酸可以三种形式存在.
即正电荷（cation）、两性离子（zwitterion）或双极性离子（dipolar ion）及负电荷（anion）等三种，若在酸性溶液中带正电荷，则在碱性溶液中带负电荷。若氨基酸在某一pH值下其净电荷为0，且在电场中不移动时，称此pH值为它的pI值（等电点）。
因为净电荷为零，净电斥力不存在的缘故，大部份蛋白质於等电点的pH值下，其溶解度最小。相反的，当溶液的pH值低於或高於pI，所有蛋白质分子所带净电荷必为同号，彼此之间有相斥力，不会凝结。
所以，将pH调到等电点的大小，则大部份的蛋白质将会沉淀，这种现象可以应用於估算某蛋白质的等电点.