巴比伦的历史特点是一连串的游牧民被新的游牧民所征服的过程。苏美尔人、阿卡德人、巴比伦人、亚述人不断变迁，与此相适应，巴比伦宗教也在不断变化的历史中适应新的历史形势而得到新的发展。
巴比伦宗教是多神教，并与自然崇拜联系在一起。原始时代宗教信仰的残余，与较后期的宗教信仰相混合，形成了巴比伦的宗教。
一系列的对各种精灵的信仰起源于古代的万物有灵观念。巴比伦宗教起初是自然宗教，崇拜宇宙间重要的自然现象，诸如天、风、山、沼、水、月亮、太阳等。巴比伦居民感到自己苏美尔“圆庙”和居民区(复原图)
公元前30世纪初，居民区围绕神庙而建，雄伟的寺塔尚未出现无力与自然界作斗争，他们满怀恐怖地看到了幼发拉底河与底格里斯河泛滥时汹涌的洪水淹没了大地；出没于荒野的野兽也公元前3000年，苏美尔人虔信宗教，为了讨得神灵喜欢，他们把自己的泥像奉献在神像前，代替自己时刻侍奉在神的身边。在人们的精神上引起了恐怖的念头。他们认为自然界中各种森严可畏的现象是某些至高无上的、有强大威力的和超自然存在物的活动，于是他们就把自然界的不同形式和表现化为神灵。随着生产力的不断发展，人们开始认识到水这一自然力的造福力量，可以灌溉土地，给人民以丰收，所以出现了善良的与造福的水神、智慧之神埃阿。埃阿是一位把一切手艺、艺术与知识教给人们的神。苏美尔人认为水是一种原始的神圣的力量，生命便是起源于这种自然力。在《创世纪》的神话开头就讲到：“上面的天还没有名字，而下面的地也还没有得到自己的称呼，只有创造了地的元始的阿普苏和一并创造了天和地的提阿玛特和穆姆，把他们的水混合在一起。”
巴比伦人不单崇拜自然界，还崇拜植物、动物。在神话和宗教艺术里便有神圣的“生命之树”和“真理之树”；人们把主生殖的神坦姆兹称为“植物国的君主”；伊什塔尔女神常常被描绘成妇女的样子，从她的身体上有枝茎生长出来；椰枣树受到人们特别的尊敬，因为这种树在经济生活中有巨大意义。在两河流域宗教里还保存了古代动物崇拜的许多残余。例如，在乌尔受到崇拜的南那就被称为“强有力的牡牛阿努”；地下世界之王涅尔伽尔神被表现为一个可怕的动物的样子：“他有牡牛的角，他背上有丛毛发；他有人的脸面、面颊……翅膀；他有狮子的前爪和站在四条腿上的身体。”水神埃阿被表现为一个带着鱼尾或是背上带着雷雨与最高的保护神——则
巴比伦宗教最普遍的是对于天空和星辰的崇拜。人们认为古代苏美尔的天神安努是最高的神，作为“父亲”和“诸神之王”的天神安努居住在最高的一重天，他坐在上天宝座上统治着世界。其余在各神中占有显著地位的是月神辛、日神乌图，此外还有自然、生命和生育女神伊什塔尔。
这一切古老而复杂的自然崇拜同祖先崇拜有着密切的关系。最高神安努一般被视为诸神之“父”，而坦姆兹神的名字意思是“真正的儿子”。自然界的神化、星宿崇拜和祖先崇拜，形成一套复杂的宗教，生动而突出地体现了宗教作用于社会的上层建筑，对巴比伦人们的生活与行为所起的决定性作用，成为后人了解巴比伦文明的金钥匙。
苏美尔“圆庙”和居民区