注册会计师实施分析程序的方法包括：
1、趋势分析法，趋势分析法主要是通过对比两期或连续数期的财务或非财务数据，确定其增减变动的方向、数额或幅度，以掌握有关数据的变动趋势或发现异常的变动；
2、比率分析法，结合其他有关信息，将同一报表内部或不同报表间的相关项目联系起来，通过计算比率，反映数据之间的关系，用以评价被审计单位的财务信息；
3、合理性测试法，通过彼此相关联的项目或造成某种变化的各种变量，测试某项目金额是否合理；
4、回归分析法，在掌握大量观察数据的基础上，利用统计方法建立因变量与自变量之间回归关系的函数表达式（即回归方程式），并利用回归方程式进行分析。
分析程序指注册会计师通过研究不同财务数据之间以及财务数据与非财务数据之间的内在关系，对财务信息作出评价。
审计分析方法根据在审计领域的应用层面可分为定性审计分析方法和定量审计分析方法，根据时间的角度可以分为事前审计分析方法、事中审计分析方法和事后审计分析方法，其中具体包括比较法、比率分析法、账户分析法、趋势分析法、模拟法、预测法、决策法、控制法、因素分析法和成本法等。
审计分析方法是审计人员在审计过程中应用分析技术进行审计事项评价的方法，具有一定的通用性以及较大的灵活性，通过分析被审计单位的会计资料，有利于反映会计资料、经济活动以及被审计单位所存在的问题的真实性。
分析性审计程序在审计实务中的运用有：
1、在风险评估阶段的具体运用。在风险评估阶段，利用分析性审计程序的目的是帮注册会计师发现财务报表中的异常变化，或与其发生而未发生的变化识别潜在的重大错报风险领域，通过对被审计单位重大错报风险的评估帮助注册会计师设计进步审计程序的性质、时间和范围，提高审计效率和效果。
2、在实质性程序中的具体运用。实质性分析程序与细节性测试都可以用于收集审计证据，以此来识别财务报表认定层次的重大错报风险。
3、在总体复核阶段的具体运用。在审计完成阶段，注册会计师需要通过执行分析程序对财务报表进行整体符合，以此来判断审计结论是否恰当以及财务报表的整体是否公允。