摩托车自动注销没有后果，因为摩托车不可能自动注销。摩托车不管多长时间都不会取消。只要不去车管所办理报废注销，就算强制报废也不会自动销户。注销户口，应当携带机动车登记证书、行驶证、身份证、驾驶证、《车辆回收证明》及其复印件或者其他遗失、被盗证明材料到车辆管理所申请注销。
根据新《机动车强制报废标准规定》第四条规定，已登记的机动车有下列情形之一的，应当强制报废，机动车所有人应当将机动车交售给报废机动车回收拆解企业，由报废机动车回收拆解企业按照规定进行登记、拆解、销毁，并将报废机动车的登记证书、号牌、行驶证交公安机关交通管理部门注销：
(一)达到本规定第五条规定的使用年限；
(二)经修理调整后，仍不符合在用车辆机动车安全技术国家标准相关要求的；
(三)经修理调整或者采用控制技术后，向大气排放污染物或者噪声仍达不到在用机动车国家标准相关要求的；
(四)检验有效期届满后连续三个机动车检验周期内未取得机动车检验合格标志的。
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