1、使用小虾进行去除：
可以买一些小虾放在鱼缸内，如果褐藻比较多的话，可以一次投放上百条，效果显著。黑壳虾比较便宜，而且容易养活，如果仅为除藻，建议此类虾。其他的虾可以观赏喂养，平时除藻。
2、专门的鱼类进行去除：
一些鱼类专门喜欢食用藻类，例如青苔鼠、黑玛丽等、泰国飞狐、鞭尾鱼等，有人说孔雀鱼也有啄食褐藻的习惯，经笔者测试，效果并不好，而且容易把水草弄坏。
3、可以使用蜗牛进行去除：
一些蜗牛是藻类的天然敌人，例如苹果螺、金苹果蜗牛等，而且蜗牛还喜欢吃一些腐殖质。但是如果繁殖过多就会危害其他的水草了。
4、人工进行去除：
人工除藻主要是针对鱼缸壁而言，可以使用清洁刷、磁性刷之类，使用医用面纱效果也特别棒。
5、注意灯光的明暗：
注意是否是因为鱼缸的灯不太亮，在昏暗的灯光下，水草光合作用较低，而褐藻却可以，所以光线不好的情况下，也容易爆藻。更换或者调高光线后，因为水草长势旺盛了，褐藻自然就被抑制了。