一、主体不同
1、ipad版：在ipad上运行的app。
2、iphone版：在iphone上运行的app。
二、适用性不同
1、ipad版：ipad版本的软件可以在iphone上运行。
2、iphone版：iphone版本的软件不能在ipad上运行。
三、分辨率不同
1、ipad版：不支持HD类的应用。
2、iphone版：大屏幕移动设备在小屏幕移动设备的兼容情况下，支持HD类的应用。
参考资料来源：百度百科-ipad软件
参考资料来源：百度百科-App Store
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