随着持续的治疗可能会减少不良反应发生的强度和频率，不良反应一般不会导致治疗的中断。
同其它选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRI)一样，常见的不良反应如下：
全身：过敏（例如，搔痒、皮疹、风疹、过敏反应、脉管炎、血清反应、颜面水肿等）（见【禁忌】和【警告】）、寒战、5-羟色胺综合征、光敏反应及非常罕见的情况下，多形性红斑有可能发展为斯-约二氏综合征或中毒性表皮坏死松解症（Lyell综合征）。
消化系统：胃肠道功能紊乱（例如腹泻、恶心、呕吐、消化不良、吞咽困难、味觉颠倒）、口干等。罕见肝功能检测异常，特发性肝炎鲜有报告。
神经系统：头痛、睡眠异常（例如梦境反常、失眠、困倦）、头晕、厌食、疲乏、欣快、短暂的动作异常（例如抽搐、共济失调、战栗、肌阵挛）、痉挛发作及罕见的精神运动性不安/静坐不能（见【注意事项】）。5-羟色胺综合征非常罕见。
精神科障碍：幻觉，躁狂反应，意识错乱，激越，焦虑及有关症状（如，紧张），注意力及思考能力减弱（如，人格解体），惊恐发作，五羟色胺综合征极罕见，自杀观念和行为（这些症状可以是由于潜在疾病造成的）。在氟西汀治疗过程中或治疗停止后早期报告有自杀观念和自杀行为（见【注意事项】）。
泌尿系统：尿潴留，尿频等。
生殖紊乱：性功能障碍（如延迟或缺少射精、性高潮缺乏）、阴茎异常勃起、溢乳。
其它：脱发、呵欠、视觉异常（如视力模糊，瞳孔散大）、出汗、血管舒张、关节痛、肌痛、体位性低血压和瘀癍。其它出血表现（例如妇科出血、胃肠道出血和其他皮肤或粘膜出血）罕有报告（见【注意事项】：出应）。
一过性低血钠：停服本品时极少数患者出现一过性低血钠（包括血钠低于110mmol/L)，且停药后可逆。某些病例可能是由于抗利尿激素分泌失调引起。多数报道见于老年人及服用利尿药的患者或其它原因导致体液耗竭的患者。
呼吸系统：咽炎和呼吸困难。肺部不良事件罕见（包括不同组织病理学的炎性变化和/或纤维化）。呼吸困难可能是最初唯一的症状。
氟西汀治疗停止时的撤药症状：氟西汀的停药通常会产生撤药症状。头晕，感觉障碍（包括感觉异常），睡眠障碍（包括失眠和多梦），乏力，激越或焦虑，恶心和/或呕吐，震颤和头痛是最常报告的不良反应。一般这些症状是轻度到中度并且是自限的，然而在一些患者中这些症状可能很严重和/或延长缓解时间（见【注意事项】）。因此，当百优解治疗需要停止时，建议逐渐地减少剂量（见【用法用量】和【注意事项】）。
儿童和青少年（参见【注意事项】）
在儿科临床试验中，抗抑郁药物治疗组较安慰剂对照组较多发生自杀相关行为（自杀企图和自杀想法）和敌对性行为。
长期使用氟西汀超过19周的安全性没有系统研究。
在儿科临床试验中，有关于躁狂和轻躁狂的反应的报告（氟西汀组2.6%，安慰剂组0%），多数导致停药。这些患者既往没有躁狂和轻躁狂的病史。
在一项儿科临床试验中，服药19周后，氟西汀组的身高增长较安慰剂对照组少1.1cm(p=0.004)，体重增长较安慰剂对照组少1.1kg (p=0.008)。临床应用中有关于生长发育迟缓的个别病例报告。
百优解用于儿童有过性成熟发育延迟或性功能障碍的个别病例报告。（参见【药理毒理】）
在儿科临床试验中还发现服用氟西汀伴随碱性磷酸酶水平降低。
