原始次生阔叶林
石洞景区是整个森林公园的核心区，这一带有近2万亩的原始次生阔叶林。原始次生林是原始森林经过多次采伐和破坏后天然更新的森林。与人工林相比，原始次生林具有景观多样、物种丰富、层次分明、结构复杂、生态功能强等优点。
水翁湿地
在鸡公仔景区（园区的东南方向）有一片沼泽，面积约152亩，形成了东莞现有不多的较大片的水翁湿地。湿地与森林、海洋并称为全球三大生态系统，被誉为“生命的摇篮”、“地球之肾”。水翁别名水榕，为桃金娘科水翁属的常绿乔木，喜生于水边，有固堤之功能，分布于我省及海南、广西、福建等省区，印度、越南、马来西亚、印度尼西亚、澳大利亚亦有分布。湿地是指天然或人工、长久或暂时之沼泽地、湿原、泥炭地、带有静止或流动的淡水、半咸水或咸水的水域地带，包括低潮位不超过6米的滨岸海域。
山杜鹃群落
在大岭山森林公园莲花山西峰，从莲花山脚往鸡公仔步道方向走约2600米，那里有一片面积达几十亩的山杜鹃群落。山杜鹃别名映山红、山石榴、山踯躅、红踯躅，为杜鹃花科杜鹃花属常绿灌木。
庙宇 观音古庙位于石洞溪边东南，石洞湖东北山上，据说过去香火甚盛，每逢庙会，善男信女络绎不绝。1994年，此庙重建，供奉观音菩萨。庙内有观音圣泉，水质洁净，泉水清甜，十分可口。另外还有八仙庙，在石洞溪西南面。
游览区、马山庙游览区、白石景区、灯芯塘景区等六个主要景区。公园最高点“茶山顶”海拔530.1米。公园内物种丰富，据初步调查，共有维管木植物105科247属346种，是集游览性、休闲性、娱乐性于一体的综合性森林公园。