1、 同卵多胞胎的影响。同卵双胞的两个人STR分型检测（亲子鉴定技术）数据完全一样，其中一个人的亲生的孩子肯定是和另外一个同卵胞人是亲子关系。
2、 外源干扰。采集血痕的个体若有输血或是骨髓移植以及干细胞移植的，需要避免，如果有可采集口腔拭子；采集口腔拭子的若吃母乳的小孩，需要避开口腔中的母乳中母亲的DNA信息，只需要间隔半小时就可以采集或是用血痕样本。
3、 近亲。同父或同母的孩子STR分型技术分析时存在亲子关系的概率为二分之一的20次方。如果近亲的情况20基因座位点的系统不能确定可以使用40位点的系统解决。
4、 人为标记因素。一般采集样本或是收到样本都是编好编号单个放如样本袋子。每一个人样本都是独立编号。同时有时间和样本类型。
5、 实验因素。一般是两个实验人员同时鉴定。肯定的不需要加测，因除了父母和孩子和自己存在亲子关系，其他人都是否定的。否定的验证实验两实验人员同时进行而且用国内外不同的人的身份试剂盒验证。
6、 技术因素。20位点三个以上不符合遗传规律才下否定的鉴定意见，肯定有20位点完全符合遗传规律且累计父权指数大于9999的两个控制指标。
7、 突变因素。尽管人类遗传突变概率为1.4%，但是当突变发生时，是可以采用父母子三人鉴定的标准或是启动40基因座位点的系统作进一步的确认。
因此。亲子鉴定出错的现象几乎是没有的。除非是没有做，只给口头结果的DNA亲子鉴定中心。
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