66问答网
所有问题
当前搜索:
全转录组测序结果分析
基因选择表达后剩下的基因怎么办
答:
转录组测序
后差异表达基因太多?这4招解决你的难题 漫画怪蜀黍 生科笔记 有用的都在这里 来自专栏生命科学 大家拿到转录组测序或者RNA-Seq结果后的各种难题,快来看看,你中了几条?难难难 1. 得到的差异表达基因太多(或者太少)?2. 功能
分析结果
到底靠不靠谱?3. 技术验证只做到qPCR这步行吗?4...
单细胞
转录组测序
知识一隅
答:
单细胞
转录组测序
(Single Cell RNA Sequencing)是在单细胞水平对mRNA进行
全转录组
扩增及高通量测序的一种高端技术,研究单个细胞内的整体基因表达情况,以及基因的结构变异。主要用于细胞分子机制中细胞异质性研究、以及样本量少而无法进行常规高通量测序等。单细胞RNA-Seq提供成千上万个单个细胞的转录谱...
90k小麦基因芯片
结果
怎么
分析
答:
转录组
学的研究对象包括mRNA和非编码RNA等。新一代高通量
测序
技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,从而准确地
分析
基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学的重要问题。基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下...
高通量
测序
技术及原理介绍
答:
对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行
全转录组测序
,从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究。或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而...
转录组测序
的大致流程?我们要测某个菌在进行某一个反应期间的转录组...
答:
以真核
转录组测序
为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目
分析
流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。
空间
转录组
技术的应用
答:
应用领域:一、肿瘤生物学:1.肿瘤微环境研究:空间
转录组
学可以揭示肿瘤和周围微环境之间的相互作用,帮助理解不同细胞类型在肿瘤进展中的作用。2.异质性
分析
:揭示肿瘤内部的细胞异质性,理解不同细胞克隆之间的空间分布。二、发育生物学:1.细胞命运决定:研究在发育过程中细胞如何根据它们的空间位置做出...
高通量
测序
的技术应用
答:
比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行
全转录组测序
(whole ...
大规模基因
组测序
技术是什么?
答:
对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行
全转录组测序
(whole transcriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究。或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过...
常规
转录组测序
和数字基因表达谱测序(RNA-seq)有什么不同?初接触,很多...
答:
不同之处在于
测序
的模板序列,前者是直接随机测序cDNA库,后者是先把模板按照一定方法打断(例如酶切或其他),只从打断位置开始测序,测序片段短,但相应深度更高。如果你已经有参考基因组,使用所谓“表达谱”测序是可以的。此外,表达谱方法更便宜,但个人觉得适用性不如
转录组
广泛,可做的
分析
有限。
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
答:
6. 通过qPCR或新一代
测序分析
分离出的RNA,鉴定出特定miRNA的靶标mRNA。Sigma-Aldrich的MISSION Target ID cDNA文库让研究人员能够在实验室内开展
全转录组
范围的miRNA和ncRNA靶基因鉴定。它是个全转录组范围的cDNA文库。在文库转染和选择之后,细胞被已知miRNA转染。对于那些包含与miRNA相互作用的cDNA的细胞...
棣栭〉
<涓婁竴椤
6
7
8
9
11
12
13
14
10
15
涓嬩竴椤
灏鹃〉
其他人还搜