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代谢组怎么分析
代谢组
学的研究方法
答:
代谢组
学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹
分析
(metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,最终了解不同化合...
用ropls进行
代谢组
PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA
分析
答:
主成分
分析
(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是对变量数超过样本数量或变量之间存在多重共线性的组学数据进行可视化、回归、分类和特征选择的常用方法。PLS和正交偏最小二乘法(OPLS)是有监督的模式,它们使用偏最小二乘回归建立
代谢
物表达量与样本类别之间的关系模型,实现对样品类别的预测,是一种建模类型的...
代谢组
学
分析
是干嘛的
答:
代谢组
学
分析
如下:一、代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。1、“发现代谢组学”,也称为非靶向代谢组学(untargetedmetabolome)的目的是研究实验组和对照组中有哪些代谢产物有统计学意义上的显著差异,更多的是从定性和半定量角度发现“代谢组”...
代谢组
学
分析
是干嘛的
答:
代谢组
学
分析
如下:一、代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。1、“发现代谢组学”,也称为非靶向代谢组学(untargeted metabolome)的目的是研究实验组和对照组中有哪些代谢产物有统计学意义上的显著差异,更多的是从定性和半定量角度发现“代谢组”...
转录
组分析怎样
寻找
代谢
通路基因
答:
总感觉中间缺少了一步?没错,就是代谢物!代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,因此能够更有效地揭示生物学及其生化、分子机理。在植物研究中,目前
代谢组
+转录组的策略已经被广泛运用于植物生理、生长发育、及逆境胁迫研究中。那么
如何
进行代谢组与转录组的关联
分析
?总...
基因组和蛋白质组之间的关系,企业常用的
分析
蛋白质组的方法有哪些
答:
可以用芯片,也可以用测序.芯片是用已知的基因探针,测序则有可能发现新的mRNA,蛋白组学针对的是全体蛋白,组要以2D-Gel和质谱为主,分为top-down和bottom-up分析方法.理念和基因组类似,将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段,在通过质量反推蛋白序列,最后进行搜索,标识已知未知的蛋白序列.
代谢组分析
的...
比较基因组 转录组 蛋白组和
代谢组
的异同
答:
蛋白组学针对的是全体蛋白,组要以2D-Gel和质谱为主,分为top-down和bottom-up分析方法.理念和基因组类似,将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段,在通过质量反推蛋白序列,最后进行搜索,标识已知未知的蛋白序列.
代谢组分析
的代谢产物,是大分子和小分子的混合物,主要也是用液相和质谱.总而言之,这些技术都...
代谢组
学跟测代谢物的含量一样吗
答:
不一样。代谢物种类多,含量差异大,结构复杂,
代谢组
学相对定量可以反映代谢物在不同样本中的相对含量;测代谢物鉴定方法主要包括质谱
分析
、核磁共振分析和高效液相色谱分析等。
代谢组
学究竟是一门什么样的研究方向?
答:
代谢组
学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及...
“基因组”“蛋白组”“转录组”“
代谢组
”的异同?
答:
蛋白组:生物体基因组所编码的全套蛋白质。鉴于蛋白质表达的时空特异性,各组织器官或者特定亚细胞结构器(如线粒体、叶绿体),甚至是外泌蛋白,也可以成为一个蛋白组。所以蛋白质组是信号转导、分子发育最为直接的手段。其主要研究手段为生物质谱,在国内以牟合蛋白为典型。
代谢组
:生物体内源性代谢...
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