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转录组测序图
二代
测序
那些事
答:
聊一聊最常用的二代
测序
那些事:
转录组
分析进阶 20170319-第01期-Illumina测序原理 主要是看一下 : 备注:黑色区域为P7;红色区域为P5;假设P5->P7 为正向 图示如下: adapter在中文是适配器或者接口的意思,在前面的内容中已经提到将测序序列打碎成片断后要将末端补平然后添加adapter...
技术| 单细胞
转录组测序
之Microwell-seq
答:
Microwell-seq 是由华人科学家独立开发的一种单细胞
测序
技术,有高通量、低成本和测序质量高的特点。Microwell给我的感觉与Iontorrent的sequencing chips很相像。Iontorrent的chips是通过将beads加到一个个小孔中测序,以此辨别每个beads上的测序信号。而Microwell则是将单细胞和beads加入小孔中进行反应,本质上...
转录组测序
流程步骤是哪些?
答:
以真核
转录组测序
为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。
技术| 单细胞
转录组测序
之10x Genomics
答:
10X Genomics 一次
测序
可以捕捉 100-80,000个细胞 ,具有极高的细胞通量。单细胞的测序通量平均也在 50,000 reads/per cell 左右,而如果使用细胞核进行测序则平均通量为 25,000 reads/per nuclei。比起使用FACS进行细胞分选的单细胞测序技术而言,10X Genomics的细胞通量有显著的提高。10X Genomics与...
单细胞
转录组测序
知识一隅
答:
单细胞
转录组测序
(Single Cell RNA Sequencing)是在单细胞水平对mRNA进行全转录组扩增及高通量测序的一种高端技术,研究单个细胞内的整体基因表达情况,以及基因的结构变异。主要用于细胞分子机制中细胞异质性研究、以及样本量少而无法进行常规高通量测序等。单细胞RNA-Seq提供成千上万个单个细胞的转录谱...
转录组
是什么,
测序
是什么,有什么用?
答:
转录组测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究...
瞬息万变不过RNA——
转录组测序
常见问题集锦
答:
A 全
转录组测序
检测的是small RNA,circRNA,lncRNA及mRNA,目的是分析其在细胞中的互作网络关系,检测方案是建两个库(一个是small RNA数据量10M,一个是lncRNA+circRNA+mRNA数据量12G),其所需样本量大于转录组测序。互作网络分析图 Q 转录组测序得到的结果验证方法有哪些?A qRT-PCR、Western blot...
转录组
结果和qRT-PCR结果又不一致?!
答:
转录组测序
(RNA-seq)将细胞内某一类型(或全部)的RNA逆转录成DNA,通过高通量测序的方法测定其序列并统计其表达水平的一项技术。是检测基因表达变化的通用方法。qRT-PCR 是指通过对 PCR 扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的分析。RNA-seq无需知道实验样本的基因...
转录组
数据绘制PCA图以及生物学重复的相关问题
答:
终于有空整理之前的东西。说绘图方法之前先要了解,转录组的PCA图的意义是什么?为了检测样本之间的离散程度,也就是重复之间差的大不大。1、绘图之前先解答样本重复的问题。
转录组测序
一般情况下需要是三个重复。但是对于完全没有接触过测序的人来讲,就很疑惑:转录组测序为啥一定要生物学重复呢?我不...
植物
转录组测序
质检2100图怎么看
答:
测序
都是先把序列打成小片段再进行拼接的,拼接过程是需要知道基因组或者EST序列信息的,否则就只能用近源物种的基因组来进行比对了。功能基因的研究也只是利用生物信息学软件来进行一个功能性的预测。
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