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转录组测序和基因组测序
怎么知道
测序
数据是
转录组
还是
基因
答:
转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的
基因组测序
,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。
转录组测序和
表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的...
为什么
转录组基因
比
基因组
序列多
答:
转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的
基因组测序
,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。
转录组测序和
表达谱其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种...
RNA
测序与
整个
基因组测序
相比有什么优势?
答:
RNA测序也就是所谓的RNA-seq,通常指的是
转录组测序
,只测细胞中的转录本。只有基因组中被转录出来的那部分能测到。通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。而
基因组测序
是整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。这是根本不同的两个东西,一个是测转录组,一个...
第二代
DNA测序
技术的操作流程
答:
1、测序文库的构建 首先准备
基因组
,然后将
DNA
随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头。如果是
转录组测序
,则文库的构建要相对麻烦些,RNA片段化之后需反转成cDNA,然后加上接头,或者先将RNA反转成cDNA,然后再片段化并加上接头。2、锚定桥接 Solexa测序的反应在叫做flow cell的...
全
基因组测序
跟
转录组测序
哪个贵
答:
全
基因组测序
贵,全基因组测序一个样品要超过一万,
转录组测序
只要几千就可以了。
常规
转录组测序和
数字
基因
表达谱测序(RNA-seq)有什么不同?初接触,很多...
答:
不同之处在于
测序
的模板序列,前者是直接随机测序cDNA库,后者是先把模板按照一定方法打断(例如酶切或其他),只从打断位置开始测序,测序片段短,但相应深度更高。如果你已经有参考
基因组
,使用所谓“表达谱”测序是可以的。此外,表达谱方法更便宜,但个人觉得适用性不如
转录组
广泛,可做的分析有限。
基因
检测的二代
测序
是什么?
答:
关于二代测序的临床应用:二代测序作为一种检测手段,主要应用于基因的生殖变异(遗传性)与体细胞变异(获得性)的检测。对于遗传病,主要的技术方案是靶向区域测序(targeted panel),全外显子测序(whole exome),全
基因组测序
(whole genome)和线粒体
DNA测序
。其中,靶向区域测序主要针对明确表型的...
转录组测序
里面的
基因
覆盖度怎么来的
答:
转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的
基因组测序
,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。
转录组测序和
表达谱其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种...
基因组测序
在植物领域的应用
答:
基因组测序
在植物领域的应用有:基因组测序、转基因技术、分子标记辅助育种、单细胞测序技术等。一、基因组测序 基因组测序是一种通过测序技术获得一个完整的基因组序列表示的方法。通过得到植物基因组的序列,可以更好地了解植物的基因组结构和功能。基因组测序可以揭示植物间的遗传差异,解析植物基因、解释...
全
基因组测序
技术
答:
问题一:全
基因组测序
的技术路线 提取基因
组DNA
,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行基因簇cluster制备或电子扩增E-PCR,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。然后对测得的序列组装成Contig,通过Paired-End的距离可进一步组装成Scaffold,进而可组装成...
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