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转录组及转录组测序
转录组
是什么,
测序
是什么,有什么用?
答:
转录组分析指对细胞内所有转录产物的集合的分析。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
转录组测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高...
转录组转录组测序
与基因表达谱的区别?
答:
因此,
转录组测序
更侧重于全面捕捉转录本的多样性,而基因表达谱则聚焦于特定基因的表达状况,两者都是研究基因表达的重要手段,但侧重点和信息深度有所差异。
转录组测序
是什么意思?
答:
转录组测序
是一种高通量测序技术,可以在单个细胞或组织中全面分析并鉴定RNA的类型、数量和序列。这种方法可以揭示基因表达、基因调控、剪切变异等方面的信息,从而帮助我们更深入地了解细胞和组织的生物学功能。转录组测序的实验流程包括RNA提取、RNA样品制备、测序、数据分析等步骤,需要综合运用生物化学、生物...
转录组测序
流程步骤是哪些
答:
转录组测序
流程步骤:1、获得物种或者组织的转录本信息;2、得到转录本上基因的相关信息,如基因结构、功能等;3、发现新的基因;4、基
转录组测序
(RNA-seq)详细建库步骤与原理
答:
转录组测序
(RNA-seq)的建库过程与原理主要包括实验设计和实际操作步骤。首先,根据研究目标选择合适的策略,如真核生物通常使用oligo dT磁珠富集mRNA,而研究lncRNA或原核生物转录组则需去除rRNA。考虑链特异性,有 stranded 和 un-stranded 两种选择。建库步骤详细如下:总RNA提取:检查纯度、浓度和完整性...
算法:单细胞
转录组测序
联合bulk转录组测序
答:
整合单细胞转录组与bulk数据的算法 单细胞
转录组测序
与bulk转录组测序的整合是癌症研究的热点,主要目标是挖掘癌症发生发展机制。本文介绍了两种关键方法:BayesPrism和Scissor。1. BayesPrism算法 BayesPrism以scRNA-seq为先验信息,通过反卷积技术,从bulk数据中推断细胞类型组成和基因表达。它在GBM、HN...
转录组测序
多久可以拿到报告
答:
转录组测序
最快10个自然日可以拿到报告。转录组广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,快速转录组仅需12个自然日(12天=建库+测序+分析周期),而安诺可以7天完成
转录测序
,使快速转录组10个自然日完成。
转录组测序
和全转录组测序的区别
答:
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。
转录组测序
的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA。转录...
转录组测序
和表达谱测序的区别是什么
答:
转录组测序
和表达谱测序的区别:转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架;表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。转录组测序和表达谱其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因...
转录组测序
的转录组测序概念
答:
转录组
(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,转录组成为研究基因表达的主要手段,转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白...
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