1、南京古生物博物馆：地球生命的起点
南京古生物博物馆，是目前世界上最大的古生物专业博物馆之一。经过几代古生物学家的艰苦努力和卓越贡献，涌现了以澄江动物群研究为代表的一大批具有世界先进水平的研究成果，积累了非常丰富的古生物化石。
集中展示了化石的奥秘和古生物的多样性，再现生物进化及其与环境协同演化的历史，揭示生物进化过程中的重大事件。
2、汤山直立人化石遗址博物馆：远古社会的猿人生活
直立人博物馆在汤山北麓，今天“水魔方”公园的东侧，在地质公园的范围内。建筑面积超过25000平方米;上下分为4层，1层与2层之间设有一个夹层;整个建筑北向采光，背靠山体。
博物馆建筑的亮点，在于它的外立面设计。直剖面是由几条蜿蜒的“曲线”叠加而成。这个图案在巨大的建筑外立面上呈现出来，就好像汤山被切开了一角，脉络清晰，一道道地层褶皱显现，以表现汤山古老的历史。它像一部无字却内涵丰富的“天书”，向我们诉说着地球在人类文明前的记忆。
3、南京地质博物馆：复原的恐龙世界
南京地质博物馆面向社会公众、尤其是广大青少年，以地球科学知识为基础，以地学科普为宗旨，以宣传科学精神为目的，兼顾地球科学研究。它的展示内容涵盖中国近现代地质发展历史、地球和生命的起源、岩石与矿物赏析、矿产资源与环境保护宣传，以及恐龙世界复原等内容，富于科普教育意义和地学知识宣教意义，是熔科学性、知识性、观赏性和趣味性为一体的国内一流的综合性地学博物馆。
4、六朝博物馆：穿越1500年走进东方大都会
六朝文化是南京最具国际影响力的文化元素和城市名片，有着丰富的文化遗存。作为美国贝氏建筑事务所设计的第一件“南京作品”，六朝博物馆将带领观众穿越到1500多年前的“东方大都会”。