《宠物小精灵》中，“异色神奇宝贝”一直都被人们理解为身体颜色与普通神奇宝贝有差异的神奇宝贝，在第二世代中，这种设定被重置，异色神奇宝贝与普通神奇宝贝的差异不单单是颜色上，在能力上也有明显的差距。细数一下出现过的异色神奇宝贝吧：
小智的“猫头夜鹰”这只猫头夜鹰的体型比其他同类小一些，但是非常聪明，可以指挥其他宝可梦作战。小智费了很大的力气才抓到它，这也是小智收服的第一只异色宝可梦。
“壶壶”普通的壶壶是一般的黄色，但是壶壶老人的壶壶身体是黄色，壳是异色，壶壶为了在岩石上挖洞筑巢而从触手尖端分泌出的体液是树果混合而成的果汁。
阿渡的“红色暴鲤龙”红色暴鲤龙作为异色宝可梦，它却是从非异色的宝可梦进化来的，招式为水炮和破坏光线，为火箭队所拥有。
纯一的“三合一磁怪”是电属性和钢属性宝可梦，在第一世代是电属性的宝可梦，能发出超强的磁力和高电压，放出的电磁波能够使方圆1公里内气温升高2度，过多的三合一磁怪会引发电磁风暴。
娜琪“大王燕”普通的达王燕背部为黑色腹部为白色，而娜琪的大王燕却呈现出与众不同的异色。
“金色鲤鱼王”金色鲤鱼王是比较受玩家欢迎的精灵，不过其位置比较难找而且较为稀有，力量和速度几乎都不行，是世界上最弱最可怜的宝可梦。
“顿甲”外型是较矮的灰色象形，黑色的鼻子一直延伸至尾部，有著一对看起来非常危险的长牙，顿甲性情温和，可是一旦被惹怒就会疯狂破坏，搞得一片狼藉。
大树的“毒粉蛾”身体呈紫色，黄色的复眼上均有三个黑点，触角为金黄的椭圆形，两对足呈深粉色，有绿色的翅膀。毒粉蛾为夜行性，喜光，较为警惕，察觉到危险时会撒下毒粉保护自己。
异色神奇宝贝有将近30种，还有异色巨金怪、刺刺耳皮丘、玛姬娜的百变怪2号、阿利多斯、姜塔的泥偶巨人、卡莉塔的三首恶龙、大岩蛇、赤红盖诺赛克特、小椿的赤面龙、卡尔的摔角鹰人、裂空座、艾米莉亚的哈克龙、小木灵、疾风的虫电宝、小谜拟、皮卡菈的“皮卡丘”、贾维斯的“耿鬼”、姬美雅的“沙奈朵”。
异色神奇宝贝又被成为闪光（发光）神奇宝贝，一直是欧皇的象征。异色神奇宝贝出现的概率约为四千分之一（当然，有特殊手段能增加这个概率，但是总体来说还是很低）
在神奇宝贝二十年来的主系列动画中，异色神奇宝贝也是极其罕见的存在，不过虽说是罕见，但并非是完全没有，小智就曾经得到过一只。就让我来看下，神奇宝贝中的异色神奇宝贝。
1.猫头夜鹰
小智的猫头夜鹰正是异色的，不知道有多少人和我一样，一开始认为小智的才是正常的颜色。还觉得为啥其他人的猫头夜鹰那么奇怪。
2.壶壶
这只异色的呼呼是壶壶老人所拥有的神奇宝贝，并且这只壶壶能用树果量产神奇糖果。
3.暴鲤龙(红色）
两只，一直是被火箭队强制进化而产生的异色神奇宝贝，据说是因为未能褪去鲤鱼王时期的红色鳞片。后被渡收服。
另一只则是弗拉达利的神奇宝贝，能进行mega进化。
4.三合一磁怪
出现在成都地区，是纯一的神奇宝贝。在白银大会中被小智的妙蛙种子击败。
5.大王燕
茵郁道馆的馆主娜琪（飞行系）的神奇宝贝，被小智的大王燕击败。
6.鲤鱼王（黄金）
一只出现在吉米回忆中的神奇宝贝，被他交换成了火恐龙（兄弟，你血亏啊）
7.顿甲（母的）
这是一只野生的顿甲，小智在小岛上发现一群顿甲，其中一只就是这只异色的（小智抓了她给你自己顿甲当压寨夫人啊）。
8.毒粉蛾（公的）
这只毒粉蝶是大树的精灵，和武藏的毒粉蝶相爱，最后武藏将自己的毒粉蝶放生（看完放生的过程真的感动哭了）两只毒粉蝶双宿双飞。
9.巨金怪
两只，一只是野生的巨金怪，追的火箭队到处跑（火箭队你太弱鸡了，这只野生的抓了能邀功的）
另一只是大吾的神奇宝贝，可以进行超级进化。
10.皮丘（皮卡丘色）
是刺刺耳皮丘的同伴，出现在片尾曲中。
11.百变怪
玛姬娜的两只百变怪之一，可以变身为闪电鸟。
12.水君、雷公、炎帝
出现在电影《 幻影的霸者 索罗亚克》和主线剧情中的不是同一只。
13.阿利多斯
小光前往丰源地区遇到的野生神奇宝贝。
14.泥偶巨人
电影《比克提尼与白英雄 莱希拉姆/黑英雄 捷克罗姆》中登场，是姜塔的神奇宝贝。
15.三首恶龙（原谅绿）
同泥偶巨人一样，出自电影《比克提尼与白英雄 莱希拉姆/黑英雄 捷克罗姆》，是卡莉塔的神奇宝贝。
16.大岩蛇
小智在小波镇遇到的一群野生大岩蛇，其中就有这只异色的大岩蛇（附注：水晶大岩蛇是另外种类，并非异色）
17.盖诺赛克特(赤红)
在盖诺赛克特军团中的领袖，颜色和其他部下不同。
18.赤面龙
野生的赤面龙，被龙系馆主小椿收服。
19.摔角鹰人
卡尔的摔角鹰人 ，和小智的那只打了一架。
20.裂空座（黑色）
出现在《光环的超魔神 胡帕》电影中，会听从小智的命令，在神兽大战中面对多只神兽不落下风。
21.哈克龙（粉色）
丽莎娜的对手艾米莉亚的神奇宝贝，是漂亮的粉红色，如果变成快龙就是屎绿色，贼丑。
22.小木灵（白色）
野生的小木灵，与小智相遇后被送回同伴身边。
23.皮卡丘
闪光的皮卡丘，有两只，一只是野生的神奇宝贝。
另一只则是番长（名字），皮卡菈的神奇宝贝，有着非常显眼的飞机头。
24.耿鬼
贾维斯的神奇宝贝，能进行mega进化，最后抛弃主人贾维斯离去。
25.沙奈朵
姬美雅的神奇宝贝，能mega进化，协助小智等人，最后逮捕了贾维斯。
26.虫电宝
出现在虫电宝竞跑中，是疾风所组参赛队“红色流星队”的主力。最后这场比赛小智等人拿了冠军。
27.谜拟Q
这只异色谜拟Q叫做小谜拟（雌性）,是阿塞罗拉的神奇宝贝。
以上就是动画中出现过的异色神奇宝贝，当然，还有许多神奇宝贝颜色和正常的神奇宝贝不同，比如粉红色的尼多王、水晶大岩蛇等等，但是他们并非是异色，而是另一个种类或者是其他原因导致的。
异色猫头夜鹰
猫头夜鹰是小智在城都地区收服的，同时也是小智唯一一只异色神奇宝贝。体型与同类相比较小，但智商明显要比同类要聪明不少，能成为其他神奇宝贝的领导者。更重要的是，异色猫头夜鹰能在战斗中保持冷静的头脑，就算面对强大的对手也能想尽办法找出敌人的弱点。
水晶大岩蛇
水晶大岩蛇是水晶洞穴中的产物，与一般的岩石系的大岩蛇不一样，水晶大岩蛇的特性和进化都是未知之数，甚至是否有mega进化还是个谜题。唯一可以确定的是，水晶大岩蛇并不惧怕水属性的招式，反而火属性的招式对它十分有效。
异色巨金怪
冠军大吾拥有一只异色巨金怪，战斗力甚至能娉美神兽。原本，巨金怪就算一种非常强大的神奇宝贝，集攻防一体。异色巨金怪的智商还要比一边的要高，同时拥有钢+超能力属性，mega进化之后，异色巨金怪的四根爪子也会得到强化，全力夹击能完全封锁死敌人的行动。
红色暴鲤龙
由于火箭队对鲤鱼王进行强制进化，以至制造出一只狂暴的红色暴鲤龙，愤怒之湖就是因此命名。这只红色的暴鲤龙要比一般的暴鲤龙强，喜欢用破坏光线来摧毁眼前的一切，最终被龙属性天王渡所收服，成为冠军阵容中十分重要的一员。
异色耿鬼
异色耿鬼是神秘科学的产物，能忽略神奇宝贝与训练家之间的训练成果，实现强制进行mega进化。作为幽灵+毒双重属性组合的神奇宝贝，异色耿鬼的战斗方式十分多变，但缺点是过分依赖力量来源。在动画中，小智就曾经成功破坏了贾维斯的进化手杖，使得mega进化后的异色耿鬼回复到原本的样子。
异色裂空座
在剧场版中，魔神胡帕曾经召唤出一只异色裂空座出来作战，而且在mega进化后更是展示出了强大的战斗力。众所周知，裂空座是镇压两大神兽固拉多和盖欧卡的最主要力量，整个天空都是属于它的领域，因此也被称为天空之神。在众多神兽中，裂空座的实力能排上前三名。
个人觉得将“喵喵”放在稀有神奇宝贝第一位绝对当之无愧，它不仅是唯一一只直立行走的喵喵，还是掌握神奇宝贝语言和人类语言的神奇宝贝翻译家，而且喵喵还会发明制作许多捕捉机器，就是因为这些特点，所以喵喵才能成为大家心目中的“超稀有”神奇宝贝，然而动画中的人们却视而不见，真的是非常令人不解。
水晶大岩蛇
水晶大岩蛇是《宠物小精灵》动画中训练家们一直寻找的稀有神奇宝贝，因为栖息在特殊的环境中，所以大岩蛇的躯体变成了晶莹剔透水晶，当光芒照射在它的身体上时，光线还会被它的身体表面折射，并呈现七彩的虹光。
金色鲤鱼王
鲤鱼王在神奇宝贝世界中，是训练家们公认“最弱”的神奇宝贝之一，而且还经常被幻想成各式各样的鲤鱼王料理，不过当它进化成暴鲤龙之后，训练家便会对它另眼相看，而金色的鲤鱼王虽然非常稀有，但因为鲤鱼王终究是鲤鱼王，就算颜色稀有也无法改变它最弱的实力，所以依然被大家忽视。
红色暴鲤龙
在进化的时候，暴鲤龙的肤色完美的遗传了鲤鱼王的体色，所以全身呈现赤红色，与普通蓝色暴鲤龙相比，红色的暴鲤龙显得更加凶暴，不过总是被自己的种群排斥，不过在我的印象中，异色的神奇宝贝不是更强么？
银色巨金怪
在《宠物小精灵》动画中，巨金怪通常都是青色，但是在「钻石&珍珠」第112集里，却出现了一只银白色的巨金怪，而且这只巨金怪还是动画中被众多训练家避而远之的凶暴神奇宝贝。