南昌大学信息工程学院下设多个系，各具特色与实力。
电子信息工程系拥有江西省"十二五"重点学科——信息与通信工程，其下设通信与信息系统、信号与信息处理为硕士点。通信工程专业是国家级特色及江西省本科品牌，参与了教育部和江西省的"卓越人才计划"。该系取得众多科研成果，如国家自然科学基金项目、国家863计划项目、工业与信息化部专项等，科研经费超过4000万元。学术成果丰硕，发表学术论文300多篇，其中SCI和EI检索分别达到70和150篇。师资力量雄厚，有长江学者特聘教授、千人计划等人才，教师队伍中硕士生导师众多。
电气与自动化工程系在控制理论与控制工程、电机与电器等多个学科领域拥有硕士学位授予权，是学校早期硕士授权专业。该系科研项目丰富，近5年来发表论文150篇，涵盖5个二级学科，科研经费超过800万元。代表性项目有直升机电源自动加载控制系统，自动化专业是江西省品牌。
计算机科学与技术系的计算机科学与技术专业是国家级特色和省品牌，参与"卓越人才计划"。该系计算机科学与技术一级学科为江西省重点学科，拥有硕士和博士点，科研项目包括国家自然科学基金和863计划。发表的学术论文中SCI和EI检索数量可观，教师队伍包括长江学者和多名学科带头人。
信息管理系的信息管理与信息系统专业是省级品牌，承担多项科研项目，包括国家自然科学基金和社会科学基金，教师队伍中博士生导师和硕士生导师比例较高，培养出众多专业人才。
南昌大学信息工程学院由计算机科学与技术系、信息管理系、电子信息工程系、电气与自动化工程系、计算中心、电工电子教学实验中心6个单位组成。学院将重点抓学生的学风和考风，抓四、六级英语考试通过率，抓计算机等级考试通过率，抓毕业设计过程的管理和控制。学院专业实验设备完备，可满足相关教学、科研和工程实验需要。