各市、县(区)建设行政主管部门负责本行政区域内工程竣工验收及备案的监督管理工作。注意在自建房之前要先办理《农村个人建房建设工程许可证》，建房竣工后，建房竣工验收合格证，最后办理自建房房产证。
农村自建房申请手续1、由建房户提出申请，填写《农村个人建房申请、审核表》;
2、所在村民委员会签署意见并加盖公章;
3、镇政府进行初审，并负责调地工作：
(1)镇村建办意见;
(2)镇土地分所意见;
4、镇政府分村定期定点张榜公布初审意见;
5、报县级机关联合审批：
(1)县规划局审核，确定规划选址意见，发批准文件;
(2)县国土资源局审核，并办理用地审批手续，发批准文件;
6、县国土资源局收取建房费用，核发《农村个人建房建设工程许可证》;
7、建房户开工前报告镇政府，镇政府现场查验，敲桩定位，并实行建设全程管理;
8、建房竣工后，建房户应向镇政府申请竣工验收;
9、镇政府会同县有关部门派人现场查验，按规定核发建房竣工验收合格证，退还建房同地保证金;
10、建房户凭验收合格证，向国土登记部门申请房地产权利登记。
房屋竣工验收规定根据《城市房地产开发经营管理条例》第17条的规定，于开发项目竣工后向项目所在地的县级以上地方人民政府房地产开发管理部门提出竣工验收申请，房地产开发主管部门收到竣工验收申请之日起30日内，对涉及公共安全的内容，组织工程质量监督、规划、消防、人防等有关部门或者单位进行的验收。
竣工验收指建设工程项目竣工后开发建设单位会同设计、施工、设备供应单位及工程质量监督部门，对该项目是否符合规划设计要求以及建筑施工和设备安装质量进行全面检验，取得竣工合格资料、数据和凭证。
竣工验收内容：
1、检查工程是否按批准的设计文件建成，配套、辅助工程是否与主体工程同步建成;
2、检查工程质量是否符合国家和铁道部颁布的相关设计规范及工程施工质量验收标准;
3、检查工程设备配套及设备安装、调试情况，国外引进设备合同完成情况;
4、检查概算执行情况及财务竣工决算编制情况;
5、检查联调联试、动态检测、运行试验情况;
6、检查环保、水保、劳动、安全、卫生、消防、防灾安全监控系统、安全防护、应急疏散通道、办公生产生活房屋等设施是否按批准的设计文件建成、合格，精测网复测是否完成、复测成果和相关资料是否移交设备管理单位，工机具、常备材料是否按设计配备到位，地质灾害整治及建筑抗震设防是否符合规定;
7、检查工程竣工文件编制完成情况，竣工文件是否齐全、准确;
8、检查建设用地权属来源是否合法，面积是否准确，界址是否清楚，手续是否齐备。