细菌基本结构：细胞壁，细胞膜，细胞质，核质。
细菌特殊结构：荚膜，鞭毛，菌毛，芽孢。
其中基本结构是为了繁殖，特殊结构是为了生存。
（一）基本结构：
细胞壁：位于细菌的最外层，包绕在细胞膜的周围，细胞的细胞壁成分各不同。
功能：1）维持细胞外形；2）保护细胞免受机械损伤和渗透压危害；3）鞭毛运动支点；4）正常细胞分裂必需；5）一定的屏障作用；6）噬菌体受体位点所在。
细胞膜：位于细胞壁的内侧，包裹细胞质的结构，是一层半透性薄膜。
功能：1）高度选择透性膜，物质运输：2）渗透屏障，维持正常渗透压；3）重要代谢活动中心；4）与壁、荚膜合成有关；5）鞭毛着生点，供运动能量。
细胞质：细胞质位于菌体内部的原生质。其在真核细胞和原核细胞中所有不同
核质：无核膜，不具备完整的核结构，故亦称为拟核。具有染色体的功能，控制细菌的各种遗传性状。
（二）特殊结构：
荚膜：细胞壁外面覆盖着的一层疏松透明粘性物质.
功能：1）抵抗干燥；2）加强致病力，免受吞噬；3）堆积某些代谢废物；4）贮存物。
鞭毛和菌毛：某些细菌表面一种纤细呈波状的丝状物，属于运动器官。
属于细菌运动器官。
芽孢：极强的抗热、辐射、化学药物和静水压的能力。所以是对不良有抗性的休眠体，每一细胞仅形成一个芽孢，其没有繁殖功能。