1907年（清光绪33年），兰州道彭英甲“农林学堂”创建，后定名为“甘肃官立中等农业学堂”。
1913年（中华民国2年），学校停办。
1917年（中华民国6年），在原址改建校舍复办，定名为“甘肃省甲种农业学校”。
1924年，更名为“甘肃省立农业学校”。
1926年，更名为“甘肃省立职业学校农科”。
1927年，更名为“甘肃省立农业职业学校”。
1929年，更名为“甘肃省立第一农业学校”。
1936年，更名为“甘肃省立农业职业学校”。
1941年，新增设三年制高级合作科。
1944年8月，更名为“甘肃省立兰州高级农业职业学校”，改设五年一贯制高级农艺科、高级森林科。
1952年，更名为“甘肃省兰州农业学校”。
1956年，定为甘肃省级重点农业学校。
1957年，成立“甘肃省农业干部学校”。
1959年，被评为全国农业社会主义建设先进单位，被甘肃省委授予“甘肃省先进集体”称号。
1960年，被农业部确定为全国农业学校先进典型、全国重点中专学校，
1960年5月，经省委批准在兰州农校的基础上成立“兰州农学院”。
1962年5月，学校停办。
1969年，搬迁清水县，更名“甘肃省清水县农业学校”。
1972年，更名为“天水地区农业学校”。
1973年，更名为“甘肃省清水农业学校”。
1975年，在“清水农业学校”的基础上成立“天水农学院”。
1978年，撤消“天水农学院”，恢复“甘肃省清水农业学校”。
1983年，复办“甘肃省农业干部学校”，成立“农业科技学校”，恢复“兰州农业学校”，
1979年，在原“兰州农业学校”校址恢复“甘肃省农业干部学校”，并成立了“甘肃省农业科技学校”。
1985年，经甘肃省政府批准，“甘肃省清水农业学校”与“甘肃省农业科技学校”合并，恢复“甘肃省兰州农业学校”，保留“甘肃省农业干部学校”。
1992年，在农业部组织的办学水平评估中被评为“B类—级学校”。
2001年，被甘肃省人民政府确立为省部级重点学校。
2004年6月26日，甘肃省人民政府将“甘肃省兰州农业学校”改建为“甘肃农业职业技术学院”。
