上海合作组织大学的法律基础建立在坚实的多边合作体系之上，主要体现在以下几个关键层面:
首先，政府间的合作由来已久，2006年6月15日，中国政府与上海合作组织成员国在上海共同签署了《上海合作组织成员国政府间教育合作协定》，标志着政府层面的合作正式启动。
接着，政府教育管理部门也积极参与，2008年10月23日，各成员国教育部在阿斯塔纳达成了《上海合作组织成员国教育部关于为成立上海合作组织大学采取进一步一致行动的意向书》，强化了教育领域的政策协调和合作意向。
最后，学校层面的合作协议也在不断推进。2010年4月26日，哈萨克斯坦、中国、吉尔吉斯斯坦、俄罗斯联邦和塔吉克斯坦五国的高等学校在莫斯科共同签订了《关于成立上海合作组织大学的合作备忘录》，明确了高校间的教育交流与合作细节。
上海合作组织大学[1]