1960年红旗岭镍矿建，1961年7月，红旗岭矿子弟学校建校，校址在红旗岭矿二号街房，校舍为6栋12间干打垒式平房，张玉清同志任第一任校长。
1962年，红旗岭镍矿划归磐石矿务局所辖，学校由“红旗岭矿子弟学校”更名为“磐石矿务局子弟学校”。
1964年，新建一栋三层教学楼，校长张玉清调离，由副校长吕毓耀同志主持全面工作，学校更名为“大岭矿子弟学校”。1965年成立高中，学校变为完全子弟学校。
1966年，学校名称改回“红旗岭矿子弟学校”。1967年，红旗岭矿转为保密厂，学校更名为“八八七厂子弟学校”。
1974年，在四号街房新建三层楼教学楼，初中、高中迁入新校舍。
1977年红旗岭镍矿（八八七厂）更名为“磐石镍矿”，学校更名为“磐石镍矿子弟学校”，1979年，又建一栋教学楼，初中迁至新校舍，初、高中分离,学校更名为“磐石镍矿三中”。
从1979年到1985年间，袁国维、费世库、杜尚侠、孙新成历任校长。
1984年，磐石镍矿成立职业高中，初中迁回高中部。 1985年，磐石镍矿由中国有色金属工业总公司接管，“磐石镍矿”更名为“吉林镍业公司”，学校更名为“吉林镍业公司第一中学”。
从1985年到1999年间，平玉林、温宝林、周玉纯、陈国义历任校长。
2000年，吉林镍业公司体制改革，成立吉林镍业集团有限责任公司，学校更名为“吉林镍业集团有限责任公司第一中学”，蔡忠维任校长兼党支部书记，金红素任副校长，杨磊任副校长。
2001年1月，金红素任校长,郭建坤任党支部副书记,黄海任副校长。
2002年7月1日，原吉林镍业集团有限公司第一中学高中部与原磐石市第十六中学高中部合并成立独立高中，金红素任校长,郭建坤任党支部副书记,黄海任副校长。2004年磐石市教育局任命朱玉广为副校长。
2007年10月15日，金红素校长调离，副书记郭建坤主持学校全面工作，2007年12月，磐石市教育局任命郭建坤任为磐石市第二中学校长兼党支部书记。
随着教育资源的整合，2013年8月1日，磐石市三所普通高中合并，原红旗岭镇的磐石二中整体迁入磐石市内，磐石实验中学高中部迁入磐石市内，红光中学汉族班合并到新磐石二中。原磐石实验中学校长杜才任新磐石二中校长兼党支部书记。
