不一样。
1、食品小经营店备案证是各地针对“三小”（即食品小作坊、小经营店和小摊点)分布广、规模小、数量多，在方便百姓生活的同时也存在一定的安全隐患情况下，加强实施管理备案证。
小经营店经营者提出经营的，需要申领小经营店登记证，此前已取得的
食品经营许可证（餐饮服务许可证、食品流通许可证）在有效期内的，不需要申领小经营店登记证（当事人申请变更的除外）。登记证、备案卡也就是“三小”的“
身份证”。
2、食品经营许可证也可称餐饮服务许可证，是单位和个人从事食品生产经营活动，经卫生行政部门审查批准后，发给的餐饮服务许可证。
根据2010年07月28日
卫生部印发的《餐饮服务许可管理办法》，“任何单位和个人从事食品生产经营活动，应当向卫生行政部门申报，并按照规定办理餐饮服务许可证申请手续；经卫生行政部门审查批准后方可从事食品生产经营活动，并承担食品生产经营的食品卫生责任。”
“
地方人民政府卫生行政部门遵守本办法，对食品生产经营者发放餐饮服务许可证。”
“
食品添加剂、保健食品和新资源食品生产企业生产活动的卫生许可，由省级卫生行政部门发放
卫生许可证。”