四川大学研究生会主席团是四川大学研究生会的决策领导机构，对校研究生会重大事务进行集体决策、分工管理与监督落实。在领导开展校研究生会工作的同时，主席团接受校党委学生工作部领导，完成校党委学生工作部交办的任务。
四川大学《星期日》编辑部是主席团领导下负责校研究生会杂志宣传和引导川大研究生校园思想主流的媒体，由主编和副主编配合中国研究生杂志在成都所设立的通联站完成采稿供稿工作，完成对校研究会的文字宣传。
四川大学研究生会秘书处是在主席团领导下负责校研究生会综合协调工作的综合职能部门，由秘书长领导，下设日常事务组、文书联络组、财务物品组和档案简报组，负责校研究生会总体协调、各种文书起草、财务管理及校研究生会工作记录、材料存档等工作。
四川大学研究生会组织部是在主席团领导之下负责校研究生会组织工作的综合职能部门，实行部长领导下的副部长分工合作制，下设日常事务组、招聘考核组、制度文化组和学习培养组，负责校研究生会干部招聘考核、规章制度完善、组织文化建设、 干部学习培养等工作。
四川大学研究生会宣传部是在主席团领导下负责校研究生会宣传工作的综合职能部门，主要负责校研究生会宣传工作的规划实施、形象宣传、指导校研究生会记者团等工作，并协助学校相关部门在研究生中开展思想政治教育与宣传工作，结合形势政策开展“形势政策大讲堂”等思想政治教育主题活动。
四川大学研究生会新媒体中心是在主席团领导下负责校研究生会网站建设和维护工作的综合职能部门，内设日常事务组、技术组、微信组、微博组。技术组主要负责校研究生会网站“凤华网”以及研会内部通讯录“燕窝”手机APP的规划、建设和维护，充分发挥校研究生会网站服务研究生会工作、服务广大研究生同学的作用。
四川大学研究生会调查研究部是在主席团领导下负责校研究生会各项调研工作的综合职能部门，内设日常事务组、内参调研组、校园调研组、社会调研组，对校研究生会调查研究工作进行规划和实施，负责与其他高校研究生会联络，指导校研究生会中国高校学生组织建设和发展研究中心等工作。
四川大学研究生会学术科技部是在主席团领导下负责校研究生会学术科技工作的专门职能部门，内设日常事务组、学术交流组、学术竞赛组和学术服务组，旨在通过发挥校研究生会的学术桥梁纽带作用，举办与承办各种层次较高的学术交流活动和竞赛活动以活跃校园学术氛围。
四川大学研究生会社会实践部是在主席团领导下负责校研究生会实践活动的组织和开展的专门职能部门，旨在创造实践平台，提高实践能力，服务广大同学，面向社会大众；坚持实践的原则，为同学们拓展视野，使同学们更好的走进社会；同时在社会实践活动中树立四川大学的良好形象。
四川大学研究生会生活服务部是在主席团领导下负责研究生会生活服务工作的专门职能部门，旨在发挥校研究生会桥梁纽带作用，增进学校与学生之间，学生与学生之间的交流与相互理解，为广大研究生同学提供更好的生活学习环境。
四川大学研究生会文艺部是在主席团领导下负责校研究生会文艺活动工作的专门职能部门，旨在发挥部门优势，发挥桥梁纽带作用，增进我校研究生文艺活动的开展，提高研究生同学的艺术鉴赏力和审美情趣。
四川大学研究生会体育部是在主席团领导下负责校研究生会体育活动工作的专门职能部门，负责筹办研究生篮球、足球、乒乓球、羽毛球、棋牌等“阳光体育”赛事活动，并负责指导校研究生会裁判队等工作。
四川大学研究生会博士生部是在主席团领导下负责校研究生会涉及博士生活动的专门职能部门，主要负责“博士论坛”学术讲座、学术研讨会及学术沙龙的定期举办，并承办巴蜀文化论坛、中华文化论坛，为博士生的学习、生活和工作等方面提供各项服务，加强博士、硕士研究生之间的沟通与交流。
四川大学江安工作部和华西工作部分别在主席团领导下负责校研究生会在江安校区和华西校区的宣传和活动任务，负责筹办江安文艺角和华西文艺角等活动，扩大校研究生会在江安校区和华西校区的影响力。
四川大学研究生会各研分会是四川大学研究生会基层组织，是切实联系广大研究生的纽带，经过多年的发展，四川大学研究生会各研分会由33个研分会组成，它们是四川大学历史文化（旅游）学院研究生分会、四川大学体育学院研究生分会、四川大学外国语学院研究生分会、四川大学文新与新闻学院研究生分会、四川大学艺术学院研究生分会、四川大学法学院研究生分会、四川大学公共管理学院研究生分会、四川大学工商管理学院研究生分会、四川大学经济学院研究生分会、四川大学中美大学战略规划研究所研究生分会、四川大学政治学院研究生分会、四川大学华西公共卫生学院研究生分会、四川大学基础医学与法医学院研究生分会、四川大学口腔医学院研究生分会、四川大学华西临床医学院研究生分会、四川大学华西药学院研究生分会、四川大学化学学院研究生分会、四川大学生命科学学院研究生分会、四川大学数学学院研究生分会、四川大学物理科学技术学院研究生分会、四川大学材料学院研究生分会、四川大学电气信息学院研究生分会、四川大学分析测试中心研究生分会、四川大学高分子学院研究生分会、四川大学国家生物医学材料工程技术研究中心研究生分会、四川大学化工学院研究生分会、四川大学计算机学院研究生分会、四川大学建筑与环境学院研究生分会、四川大学轻纺与食品学院研究生分会、四川大学水利水电学院研究生分会、四川大学制造科学与工程学院研究生分会、四川大学生物治疗国家重点实验室研究生分会、四川大学华西科技园研究生分会。
