襄阳市卫生监督局内设机构涵盖多个职能科室，致力于保障市民的健康权益。首先，办公室承担日常事务，包括文电处理、会务组织、财务管理和档案管理，确保机关高效运转。此外，它负责人事管理，如工作人员晋升、考核，以及科研教育和卫生监督员的培训。办公室还负责新闻宣传、安全保卫、保密、信访处理、政务公开和后勤管理工作，以及综合性协调工作。
在政策法规方面，政策法规科主要职责是规范卫生执法行为，进行法律、法规宣传教育，实施行政执法责任制和监督稽查。他们处理投诉举报，处理局内法律事务，对大案要案进行督查督办，并参与行政处罚案件听证、复议和行政诉讼案件的应诉与赔偿工作。
公共场所监督管理科负责全市公共场所如宾馆、饭店、商场的现场审查、许可和执法，以及突发公共卫生事件的调查处理。他们确保公共场所的卫生安全，组织定期的监督检查和监测，并处理相关违法案件，提供技术指导。
在医疗机构和放射卫生方面，医疗机构和放射卫生监督管理科负责医疗、母婴保健、放射防护和血液安全的法规落实，对医疗机构进行执业资格和活动的监督检查，打击非法行医，保障医疗市场秩序。他们还负责医疗机构的突发卫生事件调查处理和放射诊疗工作单位的现场审查与违法案件查处。
对于传染病管理，传染病监督管理科负责对传染病防治机构实施防控措施的监督，医院感染和医疗废物处置的检查，以及消毒产品和二次供水的卫生监督。同时，他们负责查处传染病防治违法案件，确保生活饮用水的安全。
最后，学校卫生监督管理科专注于全市学校卫生的监督检查，查处违法案件，并提供学校卫生和重大活动卫生安全保障的技术指导。