元坝区旅游局的组织架构主要包括局机关和直属事业单位两部分。在局机关内部，设有五个功能股室，分别是:
办公室，负责日常行政管理和协调工作。
规划产业股，主要负责旅游项目的规划和发展策略。
市场促进股，致力于旅游市场的拓展和推广。
质量规范管理股，确保旅游服务的质量和规范执行。
统计信息股，负责旅游数据的收集和分析，提供决策支持。
此外，元坝区旅游局还直属两个事业单位：
区旅游执法大队，负责旅游法规的执行和旅游市场的监督。
同样隶属于区旅游局的还有区旅游执法大队，承担相应的执法职责。
整个机构共有编制16个，其中机关编制占12名，直属事业单位编制为4名。这些编制分配旨在保证各项工作的高效运行和专业管理。