营口市发展和改革委员会的内设机构包括多个部门，负责处理各项经济和社会事务。以下是各部门的主要职责：
1. 办公室: 协助局领导处理日常政务，包括文电管理、会务组织、机要事务、档案管理等，同时负责信息、安全、保密、信访、电子政务等工作，以及行政后勤事务。
2. 国民经济综合规划科: 负责研究全市经济发展战略，编制中长期规划，分析宏观经济形势，提出宏观调控建议，组织城镇化发展和产调基金管理工作，负责起草重要文件和信息发布。
3. 固定资产投资科: 监测分析投资状况，提出投资规模和结构调整建议，制定投资管理规范，负责政府投资项目的审批和企业项目的核准，引导民间投资方向，指导工程咨询业发展。
4. 农村经济发展科: 研究农村经济发展问题，制定战略和措施，组织农业和农村经济规划，协调农业相关行业发展。
5. 工业经济发展科: 推动工业结构调整，协调工业发展规划，负责重大项目管理，引导技术装备推广和产业基地建设，研究老工业基地振兴政策。
6. 经贸流通科: 制定服务业发展规划，研究流通战略，协调商品储备和市场体系建设，负责再生资源管理和市场运行宏观管理。
7. 能源交通科: 制定能源和交通发展战略，监控能源交通建设，审核能源交通项目，指导农村新能源发展。
8. 对外经济贸易科: 分析国际资本动态，提出外资和境外投资政策，协调重大项目，编制外商投资和外贸发展规划。
9. 社会发展科: 提出社会发展战略，协调人口、教育、文化等社会发展和改革事项，编制社会发展投资计划。
10. 资源环境科: 综合分析区域经济发展，协调国土整治、环保政策，编制污染防治和循环经济规划，负责资源枯竭城市转型工作。
11. 财政金融科: 研究社会资金平衡，提出财政政策建议，负责企业债券发行，推进产业投资基金和民营经济发展。
12. 高技术产业发展科: 研究高技术产业发展，组织重大项目申报，推动技术创新和产学研合作，促进新产业形成。
13. 经济体制综合改革科: 研究经济体制改革，拟定综合性改革方案，推进专项改革并协调重大问题。