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除了之前说过的三种常见单细胞基因可视化方法外，还有一种最常用的就是直接在UMAP或者TSNE降维图上显示表达某基因的细胞，这种方式更加直观，但是只能显示一个基因，一般用于标记重要的基因。
1、降维可视化
降维可视化一般用Dimplot函数，如果使用的是UMAP方法，可以直接使用UMAPPlot函数，但是感觉效果不好或者很混乱，可以考虑使用PCAPlot函数。可以看到，聚类效果不错，PCA不同细胞群还是分开了。
2、配色及修饰
Seurat包的函数作图都有默认配色，但我一直觉得不好看，其实看很多文章发现他们的色彩搭配很好。这里简单介绍两组办法。第一种使用ggsci包，自动搭配。第二种则是从文章获取颜色，自己修饰即可。
再看下其他文章中使用过的配色，虽然差不多，但是感觉好多了。
3、基因可视化
单个基因的可视化使用FeaturePlot函数，用ggplot2修饰即可。
4、把细胞群圈起来
此外，有人问道，很多文章中用虚线框起来细胞群是如何做到的，之前我也尝试过用画PCA置信椭圆的办法，但是效果不理想，最好的方法就是导入PPT或者AI，自己动手添加。
好了，这就是今天的分享了，只是冰山一角，还有其他更多的方式，可以参考其他文献，找到适合自己的。