截至2015年1月，该校共有省部级重点学科25个，一级学科博士后科研流动站1个，一级学科博士学位授权点3个，二级学科博士学位授权点11个，一级学科硕士学位授权点12个，二级学科硕士学位授权点56个。有农业推广硕士、兽医硕士、工程硕士、翻译硕士、体育硕士、风景园林硕士6个专业学位类别，其中，农业推广硕士13个领域，工程硕士、体育硕士均为3个领域 。
省部级重点学科：农业资源利用、农业水土工程、畜牧学、植物病理学、作物遗传育种、动物食品科学、农业经济管理、农业昆虫与害虫防治、环境科学与工程、农业资源利用、植物营养学、园艺等
博士后科研流动站：植物保护
一级学科博士学位授权点：作物遗传育种、植物保护、畜牧学
一级学科硕士学位授权点：作物遗传育种、植物保护、环境科学与工程、科学技术史、作物学、农业资源利用、畜牧学、食品科学与工程、农业工程 截至2015年1月，该校共有66个本科专业，其中国家级特色专业6个、省级特色专业7个、省级重点建设专业8个。有在职人员申请硕士学位审批权和外国留学生招生权。先后拥有了国家级教学名师、国家级精品课程、国家级实验教学示范中心、国家级人才培养模式创新实验区、国家级特色专业建设点。云南省生物多样性和生物技术创新人才培养基地、云南省环境科学与工程创新人才培养基地各1个；学校还建有校内实验农场和实习工厂及60多个校外实践教学基地。
学校先后两次修订本科专业人才培养方案，2008年，以“加强基础、通专结合、强化实践”为重点，构建复合型、应用型人才培养模式，2010年，强调通专结合、分类培养，强化专业和实践教学，构建多样化的人才培养模式和体系；形成国家、省、学校三个层面的三级“质量工程”体系，共获准立项质量工程项目国家级45项、省级172项、校级81项；建设了课程开发系统、自主学习中心、实验教学中心、教学科研基地以及教学管理五大教学平台。
2001年至2015年1月，共立项资助教改项目近140项；先后获国家级教学成果二等奖2项、优秀奖1项，省级教学成果特等奖1项、一等奖9项、二等奖26项；2005-2013年，连续9年评为云南省高校毕业生就业考评优秀，入选2011-2012年度全国毕业生就业50所典型经验高校，被国务院授予“全国就业先进工作单位”荣誉称号 。
国家级特色专业：生物技术、农学、园艺、茶学、动物科学、植物保护
国家级人才培养模式创新实验区：边疆民族地区农业工程创业人才培养模式创新实验区
国家级卓越工程师教育培养计划建设专业：水利水电工程、农业机械化及其自动化
国家级精品课程：普通植物病理学、烟草栽培学
省级特色专业：农学、食品质量与安全、蜂学、水利水电工程、农业机械化及其自动化等
省级重点建设专业：生物技术、植物保护、水利水电工程、动物科学、农业资源与环境等
云南省卓越工程师教育培养计划建设专业：水利水电工程、农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、土木工程
省级精品课程：普通植物病理学、大学计算机基础、作物栽培学、烟草栽培学、普通昆虫学、普洱茶文化学、动物饲养学、鲜切花栽培学、动物育种学、农药学、土壤肥料学、牧草与草坪草种子学、土壤、植株与环境分析 （双语）、肉品工艺学、Visual Basic程序设计、植物学、动物病理学、园艺植物栽培学、农业机械学、动物生物化学、植物生理学、环境生态学
云南省高等学校实验教学示范中心：作物学实验教学中心、农业工程专业基础实验教学示范中心、烟草科学与工程实验教学中心、动物医学实验教学中心、植物保护学实验教学中心 截至2015年1月，该校先后与英国、美国、日本、韩国、法国、比利时、荷兰、加拿大、澳大利亚、新西兰、泰国、越南、缅甸、柬埔寨、老挝等22个国家的74个院校建立了学术交流合作关系。
2012年，外交部和教育部批准设立首批国家级援外教育和培训机构——中国-东盟教育培训中心。获田家炳基金会资助，建盖了国际学院田家炳楼。2014年获教育部批准成为中国政府奖学金接收外国留学生院校。
学校与荷兰劳伦斯坦应用技术大学开展“2+2”模式联合培养项目；与英国胡弗汉顿大学开展多项科研合作项目，联合培养双学位本科至博士生；与越南河内国家大学所属社会科学及人文大学、河内大学及太原农林大学等高校以“2+1+1”模式合作培养越南语专业本科生；与越南荣市大学、越南河江省教育厅、越南奠边省教育厅等开展2+3本科教育项目；与泰国大学以“2+1+1”模式联合培养泰语专业本科生。与日本鹿儿岛大学、京都府立大学、北海道大学和琉球大学等开展学生交流项目。已培养近500名本科、硕士和博士外国留学生。
学校承办中国-东盟合作基金等部委或国际组织委托的援外农业科技国际培训班10余期，为东盟等发展中国家培训国外学员300多名；与越南河内农业大学合作，为越南举办了50期农业科技培训班，培训学员1500多名。先后主持了GEF、EU、ADB等资助的20余项国际合作科研项目，常年聘请外专、外教10余名，每年有30多名国内外具有较高学术造诣的院士和专家教授到学校讲学或被聘为客座教授 。
