很多东西是不适合早晨空腹的时候吃的，例如香蕉、菠萝、山楂等都会促进胃酸分泌，破环身体平衡，空腹吃不好，而且牛奶也不可以空腹吃，因为牛奶含有丰富的蛋白质和营养成分。那么益生菌是早上空腹吃最好吗？
益生菌是有益的菌群，可以调整胃肠道功能，促进消化吸收，不一定要早上吃，什么时候吃都可以的。孩子小，脾胃功能比成人需要，肠道还发育不完善。吃了不容易消化的食物，或者暴饮暴食，就很容易出现消化不良的情况。
如果孩子出现腹泻，便秘，拉稀等消化不良的情况，最好带孩子到医院进行大便化验，看是否有异常，再咨询医生可以吃一些益生菌进行调理。益生菌有利于改善肠道功能，早上空腹吃或者饭前饭后吃都是可以的。
益生菌最好空腹服用，益生菌是一种具有活性的菌类，能够提高人的抵抗力、改善消化功能，不能和其他药物一起服用，如抗生素、止泄药物等，建议如果服用益生菌还必须服用其他药物时，俩药间隔2小时以上，以免影响药效，益生菌要用温水送服，开水会杀灭活菌的。
双歧杆菌可治疗慢性腹泻。通过用双歧杆菌对慢性腹泻患者临床观察研究表明，在服药两周以后，患者大便次数、形状异常，临床症状消失，对总有效率为90.3%，复发率低。许多国内医院已将双歧杆菌制剂作为治疗慢性腹泻的首选药物。抗生素相关性肠炎实际上是抗生素的使用，使原来过路菌或外籍菌(如肠杆菌)成为优势种群，它们大量增殖或分泌相关毒素与肠粘膜上皮细胞受体结合后使CAMP酶活性升高，大量水盐电解质丢失，而造成腹泻症状。
增殖双歧杆菌，扶植了肠道中的原籍菌，使机体定植抗力升高，有利于拮抗致病菌和条件致病菌的定植。双歧杆菌可治疗因大量使用抗生素而导致的伪膜性肠炎。有人采用双歧杆菌制剂治疗伪膜性肠炎380例，临床总治愈率无明显差异，但临床副作用和复发率均明显降低。