杭州市第二人民医院以其优质的医疗服务和特色医疗学科闻名。其中，心血管内科作为杭州市医学重点学科，拥有现代化重症监护病房，专注于多脏器功能衰竭和危重心血管病人的抢救、治疗和监护。该科室在处理复杂、疑难心血管疾病方面具备强大的技术和设备支持，其CCU病房的急性心梗死亡率已接近国内最低水平。
神经外科同样为杭州市医学重点学科，主要致力于重型颅脑损伤的救治，特别是脑血管疾病和微创脑肿瘤治疗。科室整合了颅脑创伤、脑血管疾病和肿瘤治疗等多个领域，成功开展多种神经外科疾病的诊治，其重型颅脑损伤的抢救成功率在国内处于先进水平，是杭州交通事故联合救援中心的重要支柱。
耳鼻咽喉科作为重点学科，不断在耳鼻咽喉-头颈肿瘤外科、耳显微外科等领域取得创新，填补了多项省级和市级的技术空白，综合实力位居浙江省前列，尤其在喉癌的诊治上独具优势，是诊治该疾病的重要科室。
肿瘤科作为医院的又一重点，专长于肿瘤的综合治疗，包括手术、化疗、介入和生物治疗等，熟练掌握国内外最新技术和中西医结合方法，治疗效果达到国内领先。该科室承担多项国家级和省级科研项目，并在肿瘤领域取得了显著的科研成果。
医学检验科作为重点学科，集医学、科研与教学于一体，配备了先进的检验设备。下设多个专业检验室，如放射免疫中心、临床化学检验室等，主办国家级和省级医学继续教育学习班，为医疗质量提供了强有力的技术支撑。
杭州市第二人民医院 ( 杭州师范大学临床医学院、杭州师范大学附属医院 ) 创建于1954年，是杭州市城北一所融医疗、科研教学、预防保健为一体的三级甲等综合性医院，肩负着临床医疗和医学教学双重任务。