上海市政工程设计研究院的组织架构包含了多个部门和分支机构，以确保全面的运营和专业服务。其核心组成部分包括:
党组织：负责指导和监督集团的整体工作。
行政部门：包括党委办公室、院办公室和组织人事部，主要负责日常行政管理和人力资源管理。
职能支持部门：有市场经营部、技术质量部、资产财务部、监察审计室、企业发展部和工程项目管理部，致力于市场拓展和技术研发。
专业设计院：如第一至第四设计研究院，分别专注于不同领域的工程设计，如固废处理、道路桥梁、城市设计和轨道交通隧道工程。
其他专业设计院：涵盖了建筑设计、水工综合工程、工程造价咨询、综合设计、桥梁设计、地下空间设计、园林景观设计和城乡规划设计等。
院属公司：包括工程勘察设计公司、建设工程咨询公司、工程公司、科学研究所有限公司等，提供全方位工程服务。
检测中心和信息技术中心：确保工程质量控制和数字化转型。
驻外分支机构：如第六至第十设计院及分布在各地的分院和办事处，扩展服务范围，满足各地项目需求。
通过这样的组织架构，上海市政工程设计研究院能够整合资源，为客户提供高效、专业的市政工程设计和相关服务。