海南省档案馆的主要职责在于全面贯彻和执行党和国家对于档案工作的一系列方针政策和法律法规。他们负责制定并实施本省的档案工作策略，包括政策、规章制度以及长远发展规划和计划，以确保档案工作的有序进行。
在实际操作中，他们监督并指导全省各个机关、团体、企业、事业单位以及其他组织的档案管理工作，确保所有单位都依法合规地处理档案事务，并对违反档案法规的行为进行查处，维护档案工作的法制环境。
海南省档案馆致力于档案理论与科技的研究，推动档案工作的科学化管理和现代化进程，以提升工作效率和服务质量。馆内收藏、接收、整理并深入研究具有保存价值的档案资料，通过各种形式开发和利用这些珍贵的信息资源，编辑出版档案材料，为社会公众提供广泛的服务。
此外，海南省档案馆还承担着档案知识的普及和推广工作，通过宣传手段提升全社会对档案的认识。同时，他们指导档案系统的队伍建设，负责组织全省档案系统工作人员的专业培训，以提升整个系统的专业素质和业务能力。
最后，馆内会处理上级主管单位交付的其他相关任务，确保档案工作的全面性和协调性。
遵照《海南机构编制委员会关于印发海南省档案局机构编制方案的通知》（琼编200229号）和《海南省机构编制委员会关于省档案局（馆）机构编制问题的批复》（琼编201033号）文件的精神，海南省档案局（馆）为省直属副厅级事业单位，归口省政府办公厅管理。省档案馆同时挂省档案局牌子，实行两个牌子，一套人马，合署办公，属省政府编制序列，行使省政府档案工作的管理、监督和指导职能，内设办公室（机关党委、工会）、业务指导处、法制宣传处、档案管理处、技术处、音像档案管理处、征集编研处7个处级机构。