柯尔克孜族的祖先崇拜。这种习俗源于其长期以来对萨满教灵魂不灭的信仰。萨满教认为，人死后，灵魂与肉体分离，游荡于空虚之间。一旦灵魂附体，人就能起死回生。这种观念导致了祖先崇拜。柯尔克孜族的祖先崇拜首先表现在丧葬仪式上。在古代，柯尔克孜族人用各种祭品陪葬。在叶尼塞河流域古代柯尔克孜族的墓葬中，人们发现牛、马与死者合葬，各种生活用品也随葬。对祖先的崇拜还表现在对死者的祭祀上。在祭祀仪式中，通常会宰杀牛、羊和马，为死者准备足够的食物。在《玛纳斯》年的“克托伊祭祀”一节中，描述了哈萨克族和柯尔克孜族最壮观的祭祀场面。
对祖先的崇拜通常是对英雄的崇拜，而被崇拜的祖先大多是我们自己国家的英雄。玛纳斯被柯尔克孜族人民视为整个民族的祖先，所以崇拜最集中的表现就是对英雄玛纳斯的崇拜。不仅在《玛纳斯》和民间文学中如此，在现代生活中也是如此。直到今天，柯尔克孜族人民仍然崇拜玛纳斯，仍然祈祷玛纳斯在遇到困难时得到保护。人们骂人时，常用“如果我食言，就让玛纳斯的灵魂惩罚我，玛纳斯的坟墓惩罚我，玛纳斯的力量惩罚我”。这是祖先崇拜和英雄崇拜的紧密结合。
柯尔克孜族的祖先崇拜晚于自然崇拜，这是随着社会的发展意识上的巨大变化和进步。随着祖先崇拜的出现，柯尔克孜族逐渐认识到了人的力量、作用和人格，逐渐坚定了人类战胜和改造自然的信心和勇气，逐渐从自然演变为人类的命运。这是一个认知的飞跃。
萨满文化在柯尔克孜族人民生活中的痕迹仍然随处可见。时至今日，即使是长期信仰伊斯兰教的柯尔克孜族，仍然认为腾格尔至高无上，将腾格尔与胡达相提并论，在困难的时候也经常祈求腾格尔的保佑。目前，柯尔克孜族庆祝传统节日“诺鲁孜”的所有活动都是萨满文化遗留下来的古老习惯。就连伊斯兰节日“宰牲节”期间跳的狂欢舞，也还是萨满舞。在柯尔克孜族民间文学中，随处可见萨满文化的遗迹。柯尔克孜族的英雄史诗《玛纳斯》广泛反映了萨满文化。可以说，萨满文化为柯尔克孜族文化奠定了坚实的基础，对柯尔克孜族人民的影响不可低估。
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