基因组-没有参考基因组,如何完成基因克隆?

如题所述

第1个回答  2022-06-07

分子生物学相关的实验,我做的不多,只是会简单的DNA和RNA提取,跑q,基因克隆等有限的技术。
目前,主要还是以生物信息学为主。
最近,在做一个中草药基因组,就不禁有一个疑问,如果一个物种没有参考基因组,我们怎么设计引物?怎样了解此物种的基因功能呢?

目前来说,我认为 de novo transcriptome 是最为高效的一种方式。

基本流程如下:
(1)转录组文库构建及上机测序(公司完成)
(2)raw reads 质控过滤
(3)组装和拼接

(4)全长转录本分析
(5)ORF结构预测
(6)Unigene功能注释
上述步骤,简述了一个整体的流程,具体用到的软件或者脚本不一一列出。

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